More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2068 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 257 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  69.69 
 
 		 255 aa  381  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  67.86 
 
 		 268 aa  371  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  65.75 
 
 		 257 aa  352  4e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  63.67 
 
 		 256 aa  338  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  60.71 
 
 		 263 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  59.92 
 
 		 269 aa  318  5e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  47.43 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  46.25 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  46.25 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  46.25 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  46.25 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  46.25 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  46.25 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  46.25 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  47.43 
 
 		 464 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  45.85 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  45.85 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  45.1 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  45.06 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  43.92 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.45 
 
 		 255 aa  225  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  44.53 
 
 		 458 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  46.09 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  44.14 
 
 		 458 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  46.06 
 
 		 606 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  45.1 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  41.92 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  44.71 
 
 		 457 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  44.88 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  43.48 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  44.09 
 
 		 462 aa  214  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  44.96 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  44.05 
 
 		 256 aa  211  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  43.14 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  42.19 
 
 		 462 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  44.14 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  43.7 
 
 		 461 aa  205  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  41.5 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  42.58 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  42.58 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  41.8 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  45.49 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.47 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  42.13 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  43.02 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  39.23 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  40.78 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  44.64 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  42.13 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  41.34 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  39.08 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  41.25 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  41.25 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  40.71 
 
 		 256 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  41.7 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  42.19 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  40.24 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  42.23 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  40.08 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  40.39 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  41 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  41.8 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  39.53 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  42.35 
 
 		 253 aa  188  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  40.46 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  40.84 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  38.1 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  41.86 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  40.16 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  40.77 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  39.62 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  39.23 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  40.68 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  40.61 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  41.02 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  39.23 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  41.92 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  40.68 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  41.98 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  42.15 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  39.69 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  40 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  37.21 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  39.38 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  38.76 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  37.7 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>