More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0541 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 255 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  57.65 
 
 		 255 aa  314  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  57.48 
 
 		 259 aa  298  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  51.78 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  49.02 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  48.24 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  47.43 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  41.9 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  41.34 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  41.5 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  43.02 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2234  hydrolase, TatD family  41.86 
 
 		 268 aa  220  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.291214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5476  hydrolase, TatD family  42.63 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  39.92 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  39.22 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  40.7 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0783  hydrolase, putative  40.94 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  39.06 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 		 257 aa  184  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  38.04 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  38.37 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  38.52 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  41.45 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  35.43 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  36.86 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  37.6 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  37.65 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  37.65 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.65 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.65 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  36.08 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  37.65 
 
 		 255 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  35.8 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.11 
 
 		 464 aa  175  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  37.25 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.16 
 
 		 462 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  37.89 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  38.28 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  35.27 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  37.35 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.86 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  37.5 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  37.5 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  33.73 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.17 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  38.11 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  33.73 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  35.91 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  36.08 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  36.33 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  35.91 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.13 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  35.29 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  36.65 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  36.33 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  35.27 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  35.69 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  35.02 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  35.29 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  37.22 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  35.27 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  33.98 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  35.83 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  34.35 
 
 		 458 aa  164  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  32.82 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  32.82 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  32.82 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  35.16 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  34.63 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  34.38 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  35.27 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  33.98 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  34.24 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  34.63 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  34.63 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  34.63 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  34.63 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  35.23 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  34.12 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  35 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  33.59 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  33.97 
 
 		 458 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  35.66 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  33.59 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.57 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  34.24 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  36.33 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  35.18 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  34.24 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  35.43 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  34.24 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  35.04 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  34.24 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>