More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2234 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2234  hydrolase, TatD family  100 
 
 
268 aa  555  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.291214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5476  hydrolase, TatD family  59.85 
 
 
256 aa  322  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230382  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  50.96 
 
 
256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  51.16 
 
 
265 aa  278  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  49.22 
 
 
253 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  48.05 
 
 
254 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  47.27 
 
 
255 aa  255  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  48.03 
 
 
256 aa  253  3e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  44.09 
 
 
255 aa  238  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  43.08 
 
 
259 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  40.91 
 
 
261 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  41.86 
 
 
255 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  42.58 
 
 
253 aa  227  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  39.93 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  38.37 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  39.15 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  38.76 
 
 
255 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  37.6 
 
 
256 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  38.37 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  38.37 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  38.37 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.37 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  38.37 
 
 
255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0783  hydrolase, putative  38.61 
 
 
275 aa  179  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.37 
 
 
255 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  37.21 
 
 
256 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.98 
 
 
255 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  40.38 
 
 
461 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  36.43 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.21 
 
 
462 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.85 
 
 
462 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  36.26 
 
 
256 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  39.22 
 
 
258 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  34.63 
 
 
255 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  37.31 
 
 
458 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.7 
 
 
606 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  37.6 
 
 
262 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.92 
 
 
458 aa  165  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  36.05 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  35.14 
 
 
257 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  35.14 
 
 
257 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  35.14 
 
 
256 aa  161  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  34.96 
 
 
268 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  37.08 
 
 
256 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  34.24 
 
 
256 aa  158  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.05 
 
 
255 aa  158  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  31.66 
 
 
263 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  33.85 
 
 
256 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  33.33 
 
 
255 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.27 
 
 
464 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  35.94 
 
 
253 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  32.95 
 
 
269 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  34.35 
 
 
271 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0103  TatD family hydrolase  33.72 
 
 
269 aa  152  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0970628  normal  0.125784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.05 
 
 
457 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  33.07 
 
 
256 aa  151  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  35.23 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  31.54 
 
 
255 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  34.5 
 
 
257 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  36.73 
 
 
270 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  36 
 
 
270 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  34.96 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.86 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  34.87 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  34.36 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  32.05 
 
 
459 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  34.48 
 
 
258 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  31.8 
 
 
258 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  34.11 
 
 
255 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  31.78 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  37.86 
 
 
261 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  36.64 
 
 
263 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  32.69 
 
 
265 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  32.18 
 
 
257 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  31.54 
 
 
264 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.93 
 
 
256 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  33.85 
 
 
258 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  33.08 
 
 
259 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  31.34 
 
 
265 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  32.43 
 
 
269 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 
273 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  36.33 
 
 
256 aa  142  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.93 
 
 
256 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  30.74 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  31.8 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  31.84 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  32.82 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  36.96 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  32.45 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  37.45 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  31.8 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  31.4 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  34.59 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  31.03 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  35 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  32.83 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  34.98 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  32.17 
 
 
258 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>