More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2173 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  100 
 
 
261 aa  544  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  51.57 
 
 
256 aa  280  1e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  50.59 
 
 
256 aa  276  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  46.46 
 
 
255 aa  262  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  46.83 
 
 
255 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  47.22 
 
 
259 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  45.42 
 
 
265 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  46.61 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  43.7 
 
 
254 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5476  hydrolase, TatD family  46.22 
 
 
256 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230382  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  43.65 
 
 
253 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  47.43 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2234  hydrolase, TatD family  40.91 
 
 
268 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.291214 
 
 
-
 
NC_002950  PG0783  hydrolase, putative  42.37 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  37.84 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.8 
 
 
257 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  34.54 
 
 
263 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  35.5 
 
 
271 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  33.6 
 
 
255 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  35.5 
 
 
271 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  35.02 
 
 
256 aa  156  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.6 
 
 
255 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  33.6 
 
 
255 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  33.6 
 
 
255 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  33.6 
 
 
255 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.6 
 
 
255 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.6 
 
 
255 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.2 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  33.6 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  34.9 
 
 
256 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  33.6 
 
 
269 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
271 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  35.29 
 
 
256 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  33.85 
 
 
257 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  33.07 
 
 
268 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  33.85 
 
 
257 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  32.81 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  33.86 
 
 
257 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 
256 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  32.68 
 
 
458 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  32.41 
 
 
255 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  33.47 
 
 
257 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  32.68 
 
 
458 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  34.51 
 
 
461 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  32.3 
 
 
271 aa  148  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.64 
 
 
256 aa  148  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  30.16 
 
 
255 aa  148  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 
457 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  35.74 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  32.56 
 
 
254 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  33.73 
 
 
256 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  31.76 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  29.8 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  32.68 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  32.54 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  31.23 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  33.72 
 
 
261 aa  145  9e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  32.16 
 
 
256 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  31.54 
 
 
258 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  30.59 
 
 
267 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  31.37 
 
 
255 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  31.92 
 
 
262 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  31.54 
 
 
462 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 
265 aa  142  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  32.44 
 
 
462 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.02 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  31.64 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  32.42 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  30.59 
 
 
253 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.02 
 
 
256 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  32.94 
 
 
255 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  32.16 
 
 
262 aa  138  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  32.96 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  31.37 
 
 
606 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  32.3 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  32.42 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  35.63 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  35.32 
 
 
271 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1985  glyoxalase II  32.27 
 
 
253 aa  135  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  36.27 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  32.68 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  32.42 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  30.71 
 
 
255 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  30.95 
 
 
256 aa  135  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  31.76 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  32.05 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  29.92 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  31.78 
 
 
459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  33.21 
 
 
261 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  32.69 
 
 
269 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1083  TatD-related deoxyribonuclease  31.18 
 
 
258 aa  132  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  30.98 
 
 
265 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 
256 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  33.86 
 
 
257 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  34.13 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  32.3 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  31.06 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.716983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>