More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2230 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  73.99 
 
 		 278 aa  427  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  64.47 
 
 		 273 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  62.13 
 
 		 276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3219  hydrolase, TatD family  57.14 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0721  hydrolase, TatD family  54.95 
 
 		 280 aa  295  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00103897  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.92 
 
 		 464 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  42.41 
 
 		 457 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  41.11 
 
 		 606 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  40.32 
 
 		 462 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.15 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  43.03 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  41.5 
 
 		 461 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  46.46 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  39.13 
 
 		 458 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  46.46 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  46.06 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  43.53 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.74 
 
 		 458 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  40.62 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  43.58 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  36.61 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  36.96 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  35.57 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  36.96 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 		 257 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.58 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  36.11 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  36.11 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.11 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.11 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  36.51 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  36.19 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.19 
 
 		 255 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.55 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  40 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  36.11 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  43.87 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.8 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  37.55 
 
 		 256 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.68 
 
 		 256 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  37.94 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  35.06 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  35.06 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  34.12 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  40.48 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  40.24 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  41.83 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 257 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  42.52 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  40.71 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  38.74 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  35.04 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  39.13 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  32.94 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  40.24 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  42.31 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  35.69 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  39.15 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  33.72 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 256 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  39.45 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  33.07 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  35.41 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  34.8 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  33.86 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 259 aa  172  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  38.13 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  34.12 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  34.12 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  38.25 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  38.67 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  33.46 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  38.67 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  32.68 
 
 		 251 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  40.15 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.91 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  37.89 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  39.54 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  32.95 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  35.69 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  30.43 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  36.72 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  43.53 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  36.22 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  36.22 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  39.32 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  35.8 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  37.87 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  36.84 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  36.11 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  36.51 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  35.32 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>