More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4413 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  100 
 
 		 253 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  57.94 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  54.76 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  54.55 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  53.17 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  47.2 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3606  TatD family hydrolase  50.2 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000130951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  46.03 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.63 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  46.03 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  45.63 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  45.24 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  45.24 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.24 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.24 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  45.24 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  44.84 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  45.24 
 
 		 255 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  44.05 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  41.9 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  43.25 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  44.31 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  46.67 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  40.39 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  45.82 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  43.7 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  40 
 
 		 462 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  42.13 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  41.73 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  39.22 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  38.43 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.71 
 
 		 606 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  42.35 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.48 
 
 		 457 aa  188  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  40.48 
 
 		 464 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  39.22 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  38.67 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  39.13 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  41.73 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  41.57 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  39.29 
 
 		 458 aa  185  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  40.78 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  39.29 
 
 		 458 aa  185  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  37.55 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  40.08 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  38.85 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  38.34 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  43.48 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  38.43 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  37.94 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  38.82 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  40.86 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  39.15 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  40.86 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  37.98 
 
 		 262 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  40.61 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  37.26 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  38.49 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  39.15 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  37.25 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  37.94 
 
 		 462 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  35.57 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  38.1 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  41.15 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  39.69 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  38.28 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  37.15 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  38.34 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  38.15 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 283 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 283 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 283 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  38.37 
 
 		 262 aa  174  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  38.13 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  38.28 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  39.16 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  37.94 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  38.91 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  40.32 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  38.28 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  37.8 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  37.94 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  38.31 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  36.47 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  36.61 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  40.08 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  36.19 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  36.47 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  35.18 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  38.19 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  36.08 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>