More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3458 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  50.4 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  54 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  50.4 
 
 		 258 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  53.39 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3606  TatD family hydrolase  52.99 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000130951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  47.2 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  44.22 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  39.92 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  39.29 
 
 		 256 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.32 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  40.32 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  40.32 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  40.32 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.32 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.32 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  40.32 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  39.68 
 
 		 255 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  39.92 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  44.71 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  39.92 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  39.29 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  41.57 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  38.89 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  37.15 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.34 
 
 		 606 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  42.06 
 
 		 263 aa  175  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  40.78 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  41.47 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  39.77 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3015  TatD family deoxyribonuclease  43.48 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.91144e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  40.39 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  37.65 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  39.29 
 
 		 458 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.49 
 
 		 458 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  37.94 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  37.94 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.89 
 
 		 257 aa  164  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  38.84 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  37.01 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  39.61 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  36 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  38.95 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  38.28 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 462 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  38.58 
 
 		 270 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  40.09 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  40.78 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  36.08 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  36.08 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  36.08 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  34.12 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  39.66 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  35.83 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  37.04 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  37.11 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  35.34 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.4 
 
 		 257 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  33.07 
 
 		 265 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  34.9 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  40.78 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  35.55 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  36.36 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  37.2 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  36.69 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.5 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  36.33 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.77 
 
 		 462 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  34.9 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  35.71 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  37.3 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.9 
 
 		 457 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  37.74 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  37.05 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  38.57 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  38.1 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  37.89 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  36.8 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  36.02 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  35.55 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  35.55 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.01 
 
 		 464 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  38.15 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  37.59 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  35.29 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.57 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  36.9 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  34.26 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.81 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>