More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3287 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  100 
 
 		 258 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  62.55 
 
 		 252 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  54.55 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  55.29 
 
 		 259 aa  265  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  54.51 
 
 		 259 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  50.4 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3606  TatD family hydrolase  48.22 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000130951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  39.68 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  41.83 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  46.48 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  46.48 
 
 		 258 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  38.89 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  38.89 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  38.89 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  38.89 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  38.89 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  38.89 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  38.1 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  42.86 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  44.14 
 
 		 264 aa  184  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  38.49 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  41.02 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  44.53 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  40.08 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  42.97 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  37.2 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  39.13 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  37.6 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  41.27 
 
 		 459 aa  179  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  38.19 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.92 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  36.9 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  37.74 
 
 		 283 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  38.82 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  38.82 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  38.02 
 
 		 464 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  38.34 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.76 
 
 		 457 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  43.03 
 
 		 256 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  35.97 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  36.78 
 
 		 263 aa  175  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  38.91 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  38.13 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  39.68 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  36.33 
 
 		 283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  36.33 
 
 		 283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  36.33 
 
 		 283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  36.72 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  41.02 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  40.32 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  36.08 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  38.11 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  37.15 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  35.8 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  36.76 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  37.15 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  35.94 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  36.47 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  35.27 
 
 		 263 aa  168  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  35.94 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.41 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  35.94 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  37.94 
 
 		 606 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  40.39 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  36.33 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  38.74 
 
 		 265 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  41.47 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  37.74 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  35.55 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  39.13 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  38.74 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  34.88 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  41.47 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  38.74 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  38.74 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  39.37 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.02 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  41.47 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  39.37 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  35.55 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  37.36 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  39.37 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  36.08 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  35.91 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  36.33 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  35.16 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  38.43 
 
 		 261 aa  165  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>