More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3055 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  45.56 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  46.48 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  46.48 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  46.48 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  44.79 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  45.17 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  43.97 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  44.79 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  45.17 
 
 		 260 aa  224  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  45.17 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  43.19 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  44.98 
 
 		 256 aa  222  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  45.75 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  45.34 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  45.34 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  45.34 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  44.94 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  42.64 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  42.47 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  43.08 
 
 		 257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  42.58 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  41.41 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  43.58 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  41.09 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  41.09 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  43.7 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  37.84 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  39.15 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  35.77 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  38.52 
 
 		 258 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  38.91 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  39.19 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  42.58 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  39.61 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  41.47 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  37.35 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  43.36 
 
 		 262 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  43.36 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  38.82 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  38.28 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  38.15 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  34.5 
 
 		 267 aa  185  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  37.13 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0999  TatD-related deoxyribonuclease  40.7 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000160958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  39.08 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  37.93 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  36.58 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  38.21 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  37.8 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  37.8 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  37.8 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  37.8 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  37.8 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  38.28 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  35.04 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  37.12 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  36.58 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  37.4 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  37.4 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  36.78 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  36.59 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 256 aa  175  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  36.59 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  36.59 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  36.33 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  35.37 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  36.54 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  35.77 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  41.09 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  35.41 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  36.96 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  38.58 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  37.74 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2036  TatD-related deoxyribonuclease  40.31 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  34.98 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  36.96 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2106  TatD-related deoxyribonuclease  39.15 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  37.33 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  37.31 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  34.73 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  34.87 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  37.78 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  39.46 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  36.33 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  36.33 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  34.82 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>