More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0715 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  100 
 
 
258 aa  530  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  62.5 
 
 
260 aa  332  4e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  58.53 
 
 
258 aa  311  4.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  47.27 
 
 
256 aa  265  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  46.43 
 
 
269 aa  247  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  43.92 
 
 
256 aa  234  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.82 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  45.42 
 
 
255 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  45.42 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  45.42 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.42 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.42 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  45.42 
 
 
255 aa  231  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.42 
 
 
255 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  44.62 
 
 
255 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  44.4 
 
 
265 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  44.09 
 
 
255 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  42.75 
 
 
257 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  43.14 
 
 
256 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  44.62 
 
 
255 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  42.41 
 
 
256 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  43.7 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  43.7 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  41.34 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  39.22 
 
 
258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  42.91 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 
257 aa  209  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  42.52 
 
 
256 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  41.11 
 
 
253 aa  208  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  40.32 
 
 
255 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  39.13 
 
 
257 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1551  Mg-dependent DNase  41.34 
 
 
274 aa  201  9e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 
256 aa  200  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  37.7 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.48 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  41.9 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.08 
 
 
255 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  39.45 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.37 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  37.7 
 
 
268 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  40.55 
 
 
255 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  41.73 
 
 
251 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  38.34 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  38.85 
 
 
267 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  39.37 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.32 
 
 
464 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  36.76 
 
 
271 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.69 
 
 
261 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  39.77 
 
 
258 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  36.26 
 
 
262 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  36.96 
 
 
462 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
261 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  38.04 
 
 
256 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  37.31 
 
 
264 aa  191  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  38.65 
 
 
256 aa  191  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  38.08 
 
 
267 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  37.65 
 
 
256 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  37.01 
 
 
259 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  38.46 
 
 
267 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  40.3 
 
 
258 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  37.4 
 
 
462 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 
251 aa  189  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  38.25 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  35.32 
 
 
267 aa  188  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  35.32 
 
 
262 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  38.43 
 
 
262 aa  187  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  37.4 
 
 
258 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  36.58 
 
 
273 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  38.25 
 
 
256 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.08 
 
 
606 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  38.43 
 
 
259 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  39.3 
 
 
255 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  36.58 
 
 
265 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  37.69 
 
 
257 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  38.49 
 
 
255 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  38.85 
 
 
457 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.82 
 
 
458 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  37.94 
 
 
259 aa  185  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  37.15 
 
 
258 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 
256 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.43 
 
 
458 aa  185  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  37.15 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  35.83 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  34.13 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  38.17 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  36.76 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  38.52 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  36.11 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  39.44 
 
 
262 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  38.25 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  36.05 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  37.3 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  38.34 
 
 
260 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  37.94 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  37.7 
 
 
257 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  36.76 
 
 
459 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  36.05 
 
 
260 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  36.05 
 
 
260 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>