More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3632 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  45.14 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  44 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  44.23 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  44.88 
 
 		 258 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  45.63 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  43.7 
 
 		 464 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  45.24 
 
 		 257 aa  214  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  41.5 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.23 
 
 		 255 aa  211  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.23 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  42.47 
 
 		 457 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  46.22 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  41.18 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  42.29 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  42.29 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  41.5 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  40.08 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  41.5 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  41.5 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.5 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.5 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  44.71 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  43.08 
 
 		 259 aa  204  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  40.71 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  40.71 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  41.11 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  45.14 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  41.67 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.11 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  40.71 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  39.92 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.71 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  42.13 
 
 		 606 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  37.4 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  37.4 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  43.58 
 
 		 256 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  40.54 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  40.94 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  38.37 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  39.23 
 
 		 262 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  42.75 
 
 		 264 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  39.68 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  39.84 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  41.67 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  41.67 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  39.15 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  40.32 
 
 		 462 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  38.46 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  39.15 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  38.43 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  41.02 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  35.16 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  42.58 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  37.15 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  38.7 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  42.58 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  36.65 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.37 
 
 		 462 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.3 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  40.48 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1551  Mg-dependent DNase  39.92 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  42.58 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  42.58 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  38.49 
 
 		 270 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  42.58 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  41.5 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  38.64 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.44 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  39.69 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  37.21 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  37.55 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  40.38 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  42.37 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  38.91 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  38.13 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.68 
 
 		 458 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  37.4 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  39.3 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  39.77 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  39.13 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  40.93 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  40.93 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  40.93 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  40.93 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  42.11 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.29 
 
 		 458 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  42.11 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  40.08 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  38.89 
 
 		 459 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>