More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2095 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  100 
 
 
255 aa  523  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  59.13 
 
 
255 aa  332  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  55.91 
 
 
255 aa  295  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  52.16 
 
 
255 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  52.16 
 
 
255 aa  291  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  52.16 
 
 
255 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  52.16 
 
 
255 aa  291  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  51.76 
 
 
255 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  51.37 
 
 
255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  51.37 
 
 
255 aa  288  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  51.37 
 
 
255 aa  287  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  50.59 
 
 
256 aa  285  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  51.37 
 
 
255 aa  285  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  50.98 
 
 
255 aa  285  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  51.78 
 
 
257 aa  285  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  52.36 
 
 
256 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  50.98 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  51.18 
 
 
256 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  51.97 
 
 
253 aa  278  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  48.03 
 
 
464 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  48.03 
 
 
257 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  50.39 
 
 
256 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  49.02 
 
 
606 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  49.61 
 
 
256 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  47.64 
 
 
462 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  49.21 
 
 
462 aa  263  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  47.84 
 
 
256 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  45.98 
 
 
262 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  47.04 
 
 
256 aa  255  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  48.05 
 
 
256 aa  254  9e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  50.59 
 
 
254 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  48.24 
 
 
256 aa  251  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  45.31 
 
 
257 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  45.31 
 
 
257 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  44.09 
 
 
458 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  44.09 
 
 
458 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  41.8 
 
 
461 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  43.36 
 
 
457 aa  232  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  45.45 
 
 
251 aa  230  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  42.86 
 
 
256 aa  229  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  43.7 
 
 
261 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  40.71 
 
 
258 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  44.09 
 
 
261 aa  225  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  42.58 
 
 
258 aa  221  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  41.86 
 
 
264 aa  221  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  43.63 
 
 
254 aa  219  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  41.11 
 
 
264 aa  218  5e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  39.84 
 
 
256 aa  216  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  44.71 
 
 
262 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  41.67 
 
 
264 aa  215  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  44.44 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  40.67 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  43.24 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  39.45 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  43.53 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.5 
 
 
268 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  42.69 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  41.41 
 
 
263 aa  211  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  42.69 
 
 
257 aa  211  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  40.71 
 
 
264 aa  211  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  42.8 
 
 
256 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  42.41 
 
 
258 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  38.25 
 
 
256 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 
253 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  40.94 
 
 
258 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  42.69 
 
 
259 aa  208  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  43.53 
 
 
262 aa  208  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  39.53 
 
 
268 aa  207  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  44.71 
 
 
262 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  42.02 
 
 
256 aa  206  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  40.78 
 
 
255 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  39.44 
 
 
271 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  43.48 
 
 
253 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  43.14 
 
 
262 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  40.71 
 
 
459 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  41.96 
 
 
262 aa  205  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.23 
 
 
255 aa  205  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  42.35 
 
 
262 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  42.06 
 
 
257 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  39.84 
 
 
255 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  43.14 
 
 
262 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
262 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  41.02 
 
 
259 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  41.18 
 
 
257 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  43.14 
 
 
266 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  40 
 
 
255 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  41.8 
 
 
265 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1083  TatD-related deoxyribonuclease  42.15 
 
 
258 aa  202  5e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  38.04 
 
 
265 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  43.14 
 
 
266 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  41.8 
 
 
265 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  41.8 
 
 
265 aa  201  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  41.8 
 
 
265 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
283 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
283 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
283 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  41.8 
 
 
265 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  41.8 
 
 
265 aa  201  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  41.8 
 
 
265 aa  201  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  41.8 
 
 
265 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>