More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2007 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  88.21 
 
 		 263 aa  474  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  80.23 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  81.71 
 
 		 262 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  79.09 
 
 		 263 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  80.61 
 
 		 263 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  78.33 
 
 		 263 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  66.67 
 
 		 273 aa  346  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  61.48 
 
 		 259 aa  328  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  60.08 
 
 		 271 aa  329  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  58.53 
 
 		 268 aa  322  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  61.15 
 
 		 260 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  60.77 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  63.57 
 
 		 264 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  60.31 
 
 		 264 aa  311  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  58.82 
 
 		 268 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  59.53 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  59.92 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  56.47 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  57.25 
 
 		 270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  56.2 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  53.91 
 
 		 257 aa  292  3e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  54.41 
 
 		 265 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  54.41 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  54.02 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  52.53 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  53.33 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  48.63 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  57.52 
 
 		 228 aa  261  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  48.64 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  50.79 
 
 		 265 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  53.54 
 
 		 269 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  47.71 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  46.67 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  47.66 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  48.64 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  45.14 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  46.27 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  50 
 
 		 263 aa  241  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  44.71 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  45.1 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  46.9 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  46.48 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  43.08 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  46.25 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  42.97 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  44.94 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  44.49 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  41.8 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  42.25 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  44.66 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  42.31 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  44.44 
 
 		 459 aa  217  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  44.78 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  44.78 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  42.25 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  47.27 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  47.27 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  39.45 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  39.45 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  44.94 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  41.47 
 
 		 263 aa  211  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  42.64 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  44.02 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  43.58 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  44.02 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  43.58 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  43.58 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  45.31 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  43.14 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  44.4 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  40.39 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  42.15 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  46.51 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  46.51 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  42.8 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  44.87 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  41.57 
 
 		 263 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  43.58 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  45.59 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  45.31 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  41.63 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  45.31 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.92 
 
 		 464 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  42.97 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  42.02 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  42.48 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  40.61 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  43.07 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  39.3 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  43.07 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>