More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2159 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  81.14 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  78.95 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  69.3 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  70.93 
 
 		 263 aa  323  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  70.48 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  70.04 
 
 		 264 aa  322  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  62.67 
 
 		 257 aa  294  7e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  61.5 
 
 		 262 aa  287  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  59.73 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  59.73 
 
 		 265 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  64.76 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  57.71 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  59.65 
 
 		 271 aa  267  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  57.71 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  57.14 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  56.64 
 
 		 263 aa  262  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  57.52 
 
 		 263 aa  261  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  59.73 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  55.31 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  53.74 
 
 		 270 aa  248  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  52.68 
 
 		 257 aa  241  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  53.12 
 
 		 267 aa  234  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  53.12 
 
 		 267 aa  231  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  53.12 
 
 		 270 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  52.68 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  51.56 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  53.33 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  52.44 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  52 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  50.87 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  49.55 
 
 		 265 aa  218  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  50.45 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  50 
 
 		 265 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  50.45 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  42.98 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  44.05 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  46.19 
 
 		 255 aa  201  6e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  41.78 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  43.3 
 
 		 260 aa  197  9e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  48.66 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  41.85 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  43.81 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  44.05 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  47.3 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  46.15 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  42.15 
 
 		 464 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  43.84 
 
 		 459 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  41.7 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  42.19 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  43.56 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  40.99 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  46.45 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  44.34 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  42.48 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  41.74 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  42.18 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  40.18 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  41.89 
 
 		 255 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  42.18 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  43.13 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  40.89 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  42.13 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  41.26 
 
 		 462 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  41.71 
 
 		 258 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  40.43 
 
 		 265 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  46.7 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  40.35 
 
 		 262 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  40.36 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  40.53 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  41.3 
 
 		 263 aa  177  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  41.28 
 
 		 267 aa  177  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  43.98 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  44.65 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  44.65 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  44.65 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  41.43 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  45.97 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  39.21 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  44.65 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  46.57 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  41.63 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  46.57 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  46.7 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  45.37 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  45.37 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  43.78 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  45.97 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  45.37 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  45.97 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  42.31 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  41.63 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  44.02 
 
 		 458 aa  175  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  41.63 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  40.79 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  37.39 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>