More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1289 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  100 
 
 		 259 aa  527  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  77.31 
 
 		 260 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  76.15 
 
 		 260 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  69.38 
 
 		 263 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  69.77 
 
 		 263 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  70.93 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  73.54 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  64.31 
 
 		 273 aa  345  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  62.93 
 
 		 271 aa  333  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  69.3 
 
 		 228 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  60.7 
 
 		 263 aa  329  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  60.31 
 
 		 262 aa  329  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  61.48 
 
 		 263 aa  328  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  58.2 
 
 		 257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  61.87 
 
 		 267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  60.31 
 
 		 263 aa  322  5e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  59.14 
 
 		 265 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  57.59 
 
 		 268 aa  319  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  57.75 
 
 		 270 aa  315  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  59.22 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  60.7 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  58.91 
 
 		 263 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  56.86 
 
 		 270 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  56.25 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  57.98 
 
 		 266 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  55.86 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  53.73 
 
 		 265 aa  281  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  55.08 
 
 		 265 aa  278  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  54.69 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  54.69 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  53.54 
 
 		 265 aa  274  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  53.15 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  53.54 
 
 		 265 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  51.57 
 
 		 267 aa  262  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  54.23 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  48.26 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  46.51 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  45.35 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  46.27 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  43.53 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  51.18 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  45.76 
 
 		 267 aa  235  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  45.02 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  44.65 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  43.3 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  44.44 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  44.92 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  43.13 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  42.64 
 
 		 268 aa  225  6e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  41.96 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  43.48 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  44.09 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  44.31 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  43.19 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  43.24 
 
 		 258 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  42.64 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  45.17 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  44.88 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  42.75 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  44.66 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  44.53 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  43.02 
 
 		 261 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  44.53 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  41.47 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  43.92 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  43.18 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  40.94 
 
 		 464 aa  215  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  39.92 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  43.8 
 
 		 264 aa  215  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  39.92 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  42.48 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  42.8 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  43.4 
 
 		 270 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 462 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  41.54 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  43.75 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  45.49 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  41.54 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  41.41 
 
 		 457 aa  208  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  42.69 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  42.69 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  39.69 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 262 aa  208  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  44.02 
 
 		 258 aa  207  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  40.16 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  44.57 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.08 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  44.02 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  41.38 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  42.58 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  40.3 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  42.97 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  43.58 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  46.09 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  44.31 
 
 		 458 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  39.69 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  41.7 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>