More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1584 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  100 
 
 
264 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  73.54 
 
 
263 aa  394  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  73.54 
 
 
259 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  73.15 
 
 
263 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  73.54 
 
 
264 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  70.66 
 
 
260 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  70.27 
 
 
260 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  67.84 
 
 
273 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  64.73 
 
 
268 aa  352  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  64.34 
 
 
271 aa  338  7e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  60.94 
 
 
257 aa  331  7.000000000000001e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  63.57 
 
 
267 aa  330  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  63.57 
 
 
263 aa  330  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  63.92 
 
 
270 aa  328  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  60.47 
 
 
263 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  61.09 
 
 
262 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  60.47 
 
 
265 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  61.18 
 
 
268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  60.7 
 
 
263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  60.92 
 
 
263 aa  308  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  58.78 
 
 
270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  58.75 
 
 
263 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  60.55 
 
 
265 aa  298  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  60.16 
 
 
265 aa  298  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  59.77 
 
 
257 aa  296  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  59.92 
 
 
266 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  59.77 
 
 
265 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  64.76 
 
 
228 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  58.43 
 
 
265 aa  292  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  59.06 
 
 
265 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  58.66 
 
 
265 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  56.49 
 
 
267 aa  284  8e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  57.87 
 
 
265 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  54.33 
 
 
267 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  51.54 
 
 
260 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  50.2 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  58.66 
 
 
269 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  49.41 
 
 
258 aa  265  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  48.11 
 
 
264 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  49.8 
 
 
259 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  54.14 
 
 
263 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  49.8 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  46.67 
 
 
260 aa  250  1e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  45.53 
 
 
260 aa  241  7.999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  47.64 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  48.44 
 
 
259 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  47.94 
 
 
265 aa  230  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  47.24 
 
 
257 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  45.93 
 
 
269 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  47.57 
 
 
267 aa  228  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  45.88 
 
 
254 aa  228  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  47.94 
 
 
267 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  47.19 
 
 
267 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  47.1 
 
 
270 aa  221  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  47.43 
 
 
257 aa  221  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  47.43 
 
 
257 aa  221  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  45.08 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  47.31 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  45.98 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  46.03 
 
 
459 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  44.32 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  44.57 
 
 
261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  44.53 
 
 
255 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  45.63 
 
 
264 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  44.7 
 
 
269 aa  218  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  45.59 
 
 
458 aa  218  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  44.02 
 
 
265 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  45.28 
 
 
462 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  43.48 
 
 
464 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  43.31 
 
 
606 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  42.19 
 
 
268 aa  216  4e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  43.08 
 
 
265 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  45.7 
 
 
260 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  45.7 
 
 
260 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  45.21 
 
 
458 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  45.08 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  42.25 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  45.31 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  44.92 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  44.92 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  46.18 
 
 
262 aa  211  9e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  42.52 
 
 
256 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  44.53 
 
 
258 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  43.18 
 
 
265 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  43.13 
 
 
269 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  43.13 
 
 
269 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  43.13 
 
 
269 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  43.98 
 
 
264 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.23 
 
 
255 aa  209  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  44.57 
 
 
265 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  44.57 
 
 
265 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  43.56 
 
 
264 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  43.61 
 
 
267 aa  208  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  44.57 
 
 
265 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  44.57 
 
 
265 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  44.57 
 
 
265 aa  208  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  44.57 
 
 
265 aa  208  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 
257 aa  208  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  44.57 
 
 
265 aa  208  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  44.57 
 
 
265 aa  208  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>