More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1700 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  63.92 
 
 		 268 aa  347  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  57.75 
 
 		 259 aa  315  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  54.75 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  59.22 
 
 		 273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  54.2 
 
 		 262 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  54.48 
 
 		 271 aa  308  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  55.21 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  56.47 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  55.98 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  55.98 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  54.75 
 
 		 263 aa  298  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  55.6 
 
 		 263 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  55.38 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  58.78 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  55.89 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  55 
 
 		 264 aa  288  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  55.69 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  55.69 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  55.47 
 
 		 266 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  56.06 
 
 		 265 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  55.68 
 
 		 265 aa  278  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  55.3 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  52.71 
 
 		 258 aa  275  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  49.41 
 
 		 257 aa  275  8e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  52.12 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  51.35 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  52.14 
 
 		 265 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  52.34 
 
 		 265 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  51.55 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 258 aa  261  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  47.86 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  49.42 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  52.14 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  49.61 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  53.61 
 
 		 263 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  47.91 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  53.74 
 
 		 228 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  51.56 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  45.35 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  46.33 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  45.74 
 
 		 260 aa  238  9e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  47.66 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  47.66 
 
 		 259 aa  234  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  45.17 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  45.04 
 
 		 265 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  44.36 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  44.83 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  47.04 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  47.04 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  45.83 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  44.4 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  45.06 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  49.23 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  46.15 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  49.23 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  44.03 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  43.3 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  43.02 
 
 		 258 aa  222  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  43.66 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  49.23 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  47.67 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  43.56 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  48.64 
 
 		 259 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  42.46 
 
 		 459 aa  218  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  43.77 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  45.7 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  45 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  45.7 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  39.62 
 
 		 262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  45.7 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  42.31 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  43.89 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  38.67 
 
 		 255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  43.24 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  45.31 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  44.31 
 
 		 457 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  42.13 
 
 		 263 aa  212  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  40.53 
 
 		 261 aa  212  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  39.62 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  38.28 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  44.62 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  42.15 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  46.09 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  45.7 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  40.62 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  40.23 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  46.69 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  43.77 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  41.11 
 
 		 464 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  39.06 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  42.25 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  39.77 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  42.49 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  38.74 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  44.87 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  44.87 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>