More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3626 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  100 
 
 		 264 aa  537  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  47.06 
 
 		 462 aa  248  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  50 
 
 		 464 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  47.43 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  48.47 
 
 		 606 aa  244  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  49.62 
 
 		 462 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  47.62 
 
 		 458 aa  241  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  50.99 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  44.71 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  53.22 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  50.59 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  47.22 
 
 		 458 aa  238  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  47.06 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  47.22 
 
 		 457 aa  231  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  48.63 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  47.01 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  44.49 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  44.09 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  50.99 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  42.35 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  42.35 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.35 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.35 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  46.69 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.96 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  44.27 
 
 		 461 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  42.06 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  41.96 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  41.96 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  41.96 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  44.27 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  46.09 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.96 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  41.96 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  44.49 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  44.49 
 
 		 459 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  45.53 
 
 		 258 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  43.41 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  40.48 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  41.47 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  45.14 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  41.67 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  42.91 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  41.63 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  42.08 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  42.47 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  42.08 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  42.08 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  46.09 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  44.14 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  44.22 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  43.58 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  41.5 
 
 		 254 aa  205  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  44.05 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  40.31 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  42.69 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  39.61 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  41.25 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  37.01 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  41.5 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  41.31 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  43.48 
 
 		 270 aa  202  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  43.48 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  40.93 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  39.53 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  42.91 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  40.93 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  43.7 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  39.69 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  41.25 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  41.5 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  39.69 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  38.85 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  39.38 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  40 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  38.04 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  43.25 
 
 		 262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  42.46 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  38.46 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  40.54 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  42.29 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  39.06 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  40.54 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  39 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  42.91 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  40.98 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  38.34 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  41.25 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  38.28 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  42.52 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  42.52 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  38.91 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  40.71 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  39.92 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  38.1 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  42.02 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>