More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0068 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  100 
 
 
253 aa  524  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  52.96 
 
 
256 aa  275  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  50 
 
 
256 aa  271  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  50.39 
 
 
255 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  51.97 
 
 
255 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  50.79 
 
 
257 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  48.82 
 
 
256 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  50.2 
 
 
257 aa  264  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  48.03 
 
 
255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  47.64 
 
 
255 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  47.64 
 
 
255 aa  257  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  47.64 
 
 
255 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  47.64 
 
 
255 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  47.64 
 
 
255 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  47.64 
 
 
255 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  47.64 
 
 
255 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  48.43 
 
 
255 aa  255  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  47.24 
 
 
255 aa  254  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  47.24 
 
 
255 aa  254  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  46.06 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  50 
 
 
464 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  47.62 
 
 
256 aa  247  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  45.67 
 
 
256 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  46.67 
 
 
256 aa  245  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  42.86 
 
 
256 aa  241  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  45.42 
 
 
256 aa  239  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  45.1 
 
 
462 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  44.27 
 
 
256 aa  235  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  47.06 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  47.06 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  43.87 
 
 
256 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  43.85 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  47.22 
 
 
261 aa  231  7.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  43.2 
 
 
258 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  45.85 
 
 
259 aa  229  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  43.92 
 
 
606 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  44.27 
 
 
267 aa  228  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  44.49 
 
 
264 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  43.14 
 
 
462 aa  225  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  45.45 
 
 
261 aa  224  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  43.31 
 
 
461 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  42.91 
 
 
458 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  42.52 
 
 
458 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  42.29 
 
 
457 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  42.35 
 
 
264 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  43.58 
 
 
257 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  43.7 
 
 
260 aa  215  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  40.94 
 
 
254 aa  214  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  41.2 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  40.24 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  41.9 
 
 
258 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  38.65 
 
 
256 aa  209  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  41.11 
 
 
258 aa  208  8e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  40.71 
 
 
258 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  41.02 
 
 
255 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  41.11 
 
 
256 aa  206  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.62 
 
 
255 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  41.86 
 
 
255 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  42.8 
 
 
257 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  40.93 
 
 
254 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  41.57 
 
 
264 aa  201  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  43.19 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  42.86 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  43.7 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  39.36 
 
 
265 aa  198  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  42.19 
 
 
261 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  44.05 
 
 
257 aa  198  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  40.61 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  41.31 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  42.68 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  40.48 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  39.37 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  39.76 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  42.41 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  43.24 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  41.96 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  42.02 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  39.29 
 
 
255 aa  196  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  42.02 
 
 
258 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  38.43 
 
 
258 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  42.64 
 
 
267 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  42.06 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  40.78 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  42.64 
 
 
267 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  43.8 
 
 
262 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  42.41 
 
 
259 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  38.49 
 
 
253 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  42.19 
 
 
257 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  42.29 
 
 
262 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  42.53 
 
 
270 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  40.39 
 
 
262 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  42.26 
 
 
267 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  43.19 
 
 
256 aa  192  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  40.55 
 
 
263 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  40.39 
 
 
263 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  42.91 
 
 
259 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  38.74 
 
 
263 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  39.22 
 
 
255 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>