More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0747 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  99.26 
 
 
271 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  97.05 
 
 
271 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  63.33 
 
 
265 aa  359  3e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  60.78 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  61.09 
 
 
261 aa  311  5.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  58.43 
 
 
266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1985  glyoxalase II  58.8 
 
 
253 aa  289  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1083  TatD-related deoxyribonuclease  56.86 
 
 
258 aa  286  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0299  putative deoxyribonuclease Sll1786  58.75 
 
 
256 aa  287  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  40 
 
 
251 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  41.76 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  38.61 
 
 
256 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  37.69 
 
 
256 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  38.61 
 
 
255 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  39.38 
 
 
255 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  37.69 
 
 
256 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  38.22 
 
 
253 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  39.23 
 
 
258 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  38.91 
 
 
256 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  39.3 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  40.47 
 
 
255 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  37.55 
 
 
256 aa  182  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  39 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  40.08 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  40.08 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.08 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  38.11 
 
 
256 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.08 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  39.3 
 
 
255 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  39.69 
 
 
255 aa  178  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  39.69 
 
 
255 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.15 
 
 
457 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  39.3 
 
 
255 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  39.69 
 
 
255 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  39.69 
 
 
255 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 
258 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  37.79 
 
 
262 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  36.92 
 
 
256 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  39.38 
 
 
255 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  33.97 
 
 
256 aa  175  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  36.54 
 
 
257 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  36.54 
 
 
257 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.11 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  36.09 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  37.16 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.15 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  37.69 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  36.15 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  36.29 
 
 
459 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  35.77 
 
 
255 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
261 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.46 
 
 
257 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  38.11 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.12 
 
 
606 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  38.76 
 
 
254 aa  171  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  37.31 
 
 
262 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  35.27 
 
 
262 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  35.23 
 
 
255 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  35.63 
 
 
259 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  34.22 
 
 
464 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  35.23 
 
 
264 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  36.64 
 
 
269 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  35.27 
 
 
262 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  37.64 
 
 
260 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  37.16 
 
 
253 aa  168  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  37.36 
 
 
264 aa  168  9e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  36.92 
 
 
266 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  34.85 
 
 
255 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.98 
 
 
462 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 
265 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 
458 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  32.95 
 
 
260 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  36.09 
 
 
263 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  35.25 
 
 
256 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  36.54 
 
 
266 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  35.38 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  34.47 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  36.29 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  34.21 
 
 
264 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  36.15 
 
 
262 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  36.12 
 
 
276 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  36.15 
 
 
283 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  36.54 
 
 
280 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  36.15 
 
 
283 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  36.15 
 
 
283 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  36.54 
 
 
274 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.09 
 
 
462 aa  165  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  35.38 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  35.38 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  35.27 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  35.38 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  35.38 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  35.27 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  35.38 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  35.38 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  35.38 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  33.21 
 
 
458 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  36.15 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.02 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>