More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1192 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  64.68 
 
 
265 aa  335  5e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  64.2 
 
 
261 aa  333  1e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  60.78 
 
 
271 aa  320  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  60 
 
 
271 aa  319  3e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  60 
 
 
271 aa  318  7.999999999999999e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  59.38 
 
 
266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0299  putative deoxyribonuclease Sll1786  59.53 
 
 
256 aa  298  6e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1985  glyoxalase II  60.64 
 
 
253 aa  297  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1083  TatD-related deoxyribonuclease  53.31 
 
 
258 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  40.68 
 
 
255 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  43.63 
 
 
255 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  40.84 
 
 
257 aa  205  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  40.93 
 
 
253 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  40.77 
 
 
257 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  40.77 
 
 
257 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  40 
 
 
251 aa  201  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  39.92 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  42.25 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.35 
 
 
255 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  41.35 
 
 
255 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  40.98 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  40.98 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.98 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.98 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  38.61 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  41.67 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  40.98 
 
 
255 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  39.62 
 
 
259 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  39.06 
 
 
258 aa  195  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  40.7 
 
 
266 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  40.7 
 
 
266 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  40.6 
 
 
255 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  40.7 
 
 
274 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.98 
 
 
255 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 
256 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  40.23 
 
 
255 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
262 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.93 
 
 
464 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  41.6 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  37.21 
 
 
269 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  37.21 
 
 
269 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  37.21 
 
 
269 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  37.21 
 
 
269 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  37.21 
 
 
269 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  37.21 
 
 
269 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 
254 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  37.21 
 
 
269 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  39.85 
 
 
256 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  39.47 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  39.15 
 
 
262 aa  188  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  38.76 
 
 
262 aa  188  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  36.92 
 
 
255 aa  188  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  37.98 
 
 
263 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  39.15 
 
 
262 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  36.82 
 
 
259 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 
262 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  39 
 
 
262 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  37.98 
 
 
255 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  38.7 
 
 
457 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  36.43 
 
 
259 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  38.37 
 
 
255 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 
261 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  36.43 
 
 
259 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  39 
 
 
262 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  36.43 
 
 
259 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  36.43 
 
 
259 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  38.7 
 
 
258 aa  185  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  39.15 
 
 
262 aa  185  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  38.78 
 
 
264 aa  185  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  36.43 
 
 
260 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  37.98 
 
 
262 aa  185  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  37.98 
 
 
283 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  36.43 
 
 
260 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  37.98 
 
 
283 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  35.27 
 
 
256 aa  184  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  37.98 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  38.31 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  38.46 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  39.31 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  38.46 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.22 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  37.21 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  39.31 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  39.31 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  37.98 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  38.76 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  37.21 
 
 
263 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  39.23 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  38.93 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  38.93 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  37.6 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  39.08 
 
 
253 aa  181  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  35.74 
 
 
263 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 
257 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  36.96 
 
 
258 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  38.55 
 
 
265 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 
257 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  38.93 
 
 
265 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.12 
 
 
462 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>