More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1083 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1083  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  60.78 
 
 
266 aa  322  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  57.65 
 
 
271 aa  303  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  56.86 
 
 
271 aa  301  9e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  56.47 
 
 
271 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  58.27 
 
 
265 aa  296  1e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  55.25 
 
 
254 aa  289  4e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0299  putative deoxyribonuclease Sll1786  57.36 
 
 
256 aa  285  4e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  56.42 
 
 
261 aa  285  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1985  glyoxalase II  53.82 
 
 
253 aa  266  2e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  45.21 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  45.59 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.21 
 
 
255 aa  215  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  45.59 
 
 
255 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  45.59 
 
 
255 aa  215  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.59 
 
 
255 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.59 
 
 
255 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  44.83 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  45.21 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.21 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  44.06 
 
 
255 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  41.83 
 
 
257 aa  208  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  41.83 
 
 
257 aa  208  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  43.3 
 
 
256 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  39.92 
 
 
256 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  41.76 
 
 
256 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  41.67 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  42.15 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.31 
 
 
257 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  40.93 
 
 
256 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  41.54 
 
 
255 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 
255 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  41.35 
 
 
606 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  39 
 
 
251 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  38.85 
 
 
256 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.46 
 
 
256 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  39 
 
 
253 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  38.58 
 
 
262 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  40.53 
 
 
258 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.74 
 
 
457 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  39.38 
 
 
254 aa  185  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  37.97 
 
 
462 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  39.3 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  42.32 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  38.93 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  39.46 
 
 
263 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  40.23 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  37.64 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.77 
 
 
459 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  39.31 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  38.85 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  39.31 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  37.4 
 
 
269 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  37.4 
 
 
269 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  37.4 
 
 
269 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  37.4 
 
 
269 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  37.4 
 
 
269 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  37.4 
 
 
269 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  38.08 
 
 
256 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  37.4 
 
 
269 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  36.5 
 
 
258 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.36 
 
 
464 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  38.7 
 
 
263 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  38.08 
 
 
256 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  36.15 
 
 
256 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.74 
 
 
458 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  37.55 
 
 
261 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  39.62 
 
 
255 aa  178  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 
458 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.26 
 
 
462 aa  178  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  37.64 
 
 
264 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  37.16 
 
 
257 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  38.31 
 
 
258 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  38.11 
 
 
262 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  36.88 
 
 
262 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  41.27 
 
 
253 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 
258 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  37.79 
 
 
269 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  39.16 
 
 
263 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  35.66 
 
 
257 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  37.98 
 
 
257 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  37.98 
 
 
257 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  37.36 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  37.55 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  35.14 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  36.98 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  37.55 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  36.92 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  36.98 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  38.46 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  38.17 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  37.74 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  38.17 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  36.98 
 
 
262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  38.64 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  38.08 
 
 
256 aa  172  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  35.52 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  38.17 
 
 
260 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.62 
 
 
260 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>