More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0604 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  84.73 
 
 
262 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  77.22 
 
 
277 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  69.92 
 
 
261 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  64.68 
 
 
263 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  64.68 
 
 
263 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  55.69 
 
 
264 aa  319  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  56.86 
 
 
264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  55.29 
 
 
264 aa  317  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  55.69 
 
 
264 aa  315  4e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  54.55 
 
 
273 aa  299  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  54.05 
 
 
261 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  57.2 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  52.92 
 
 
261 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1521  Sec-independent protein translocase TatD  54.3 
 
 
265 aa  277  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0926881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  51.76 
 
 
265 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  51.76 
 
 
265 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  50.98 
 
 
270 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  47.47 
 
 
261 aa  202  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 
259 aa  198  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  43.58 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  43.31 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  41.6 
 
 
461 aa  195  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  37.6 
 
 
256 aa  192  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  39.69 
 
 
462 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  44.62 
 
 
256 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  44.96 
 
 
261 aa  191  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  40.08 
 
 
255 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  38.76 
 
 
457 aa  185  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  39.31 
 
 
606 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  39.69 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  41.31 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  39.76 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  38.98 
 
 
255 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  36.19 
 
 
260 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  38.98 
 
 
255 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  38.98 
 
 
255 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.98 
 
 
255 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  43.36 
 
 
254 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  40.08 
 
 
462 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  40.08 
 
 
262 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  38.98 
 
 
255 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  38.19 
 
 
255 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  36.33 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  43.14 
 
 
257 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  43.14 
 
 
257 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  38.58 
 
 
255 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.89 
 
 
464 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.58 
 
 
255 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  38.58 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  42.58 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  41.54 
 
 
271 aa  178  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  39.37 
 
 
270 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  39.15 
 
 
260 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 
260 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.52 
 
 
458 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.91 
 
 
458 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  34.51 
 
 
255 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  38.19 
 
 
255 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  38.76 
 
 
256 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  37.74 
 
 
253 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  40.23 
 
 
255 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  38.7 
 
 
263 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  40.86 
 
 
255 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  43.46 
 
 
262 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  37.74 
 
 
254 aa  175  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  41.92 
 
 
262 aa  175  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  40.15 
 
 
259 aa  175  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  41.38 
 
 
256 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  41.47 
 
 
257 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  41.22 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  36.96 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  37.93 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  39.62 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  39.69 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.89 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  41.31 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  38.91 
 
 
269 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  39.69 
 
 
255 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 
256 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  40.93 
 
 
264 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  38.91 
 
 
253 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
263 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  42.19 
 
 
257 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  41.96 
 
 
258 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  40.23 
 
 
459 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 
256 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  38.7 
 
 
263 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  35.8 
 
 
258 aa  169  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  39.53 
 
 
263 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  38.13 
 
 
257 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  38.13 
 
 
257 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  40.77 
 
 
262 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  44.09 
 
 
262 aa  168  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 
267 aa  168  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  40.08 
 
 
262 aa  168  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  40.39 
 
 
259 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  39.3 
 
 
262 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>