More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0265 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 253 aa  528  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  68.77 
 
 		 259 aa  371  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  63.24 
 
 		 255 aa  350  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  51.78 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  48.41 
 
 		 256 aa  265  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  46.61 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5476  hydrolase, TatD family  47.81 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  46.25 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  45.85 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  44.84 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  43.87 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  44.27 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  41.47 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2234  hydrolase, TatD family  42.58 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.291214 
 
 
-
 
NC_002950  PG0783  hydrolase, putative  44.05 
 
 		 275 aa  211  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  37.8 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.8 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  37.8 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  37.8 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  37.8 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.4 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  39.37 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  36.61 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  37.65 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  37.65 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  37.65 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  35.43 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  34.78 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  34.78 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  34.39 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  36.11 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  36.6 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  35.41 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  35.83 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  37.55 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  37.01 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  33.6 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  34.9 
 
 		 606 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.07 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  35.02 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  35.29 
 
 		 457 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.12 
 
 		 462 aa  168  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 		 458 aa  168  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 462 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  34.39 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 458 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.43 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  35.27 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  35.83 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  33.73 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  37.11 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  34.51 
 
 		 464 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  34.9 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.41 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  36.08 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  32.81 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  32.03 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  33.6 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  34.65 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  34.65 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  36.47 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  32.03 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  33.2 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  34.65 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  31.89 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  31.89 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  34.25 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  34.52 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0883  mttC protein, putative  34.36 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.162924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.94 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  32.16 
 
 		 461 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  31.89 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  31.1 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  34.38 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  32.95 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  33.46 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  32.41 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  36.33 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  33.98 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  30.35 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  33.07 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  34.24 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  32.68 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  32.94 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>