More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02785 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  100 
 
 
255 aa  533  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  68.9 
 
 
259 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  63.24 
 
 
253 aa  350  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  57.65 
 
 
255 aa  314  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  48.62 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  45.49 
 
 
256 aa  264  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  46.46 
 
 
261 aa  262  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5476  hydrolase, TatD family  48.21 
 
 
256 aa  256  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230382  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  45.85 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  44.88 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  44.27 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  43.87 
 
 
255 aa  240  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2234  hydrolase, TatD family  44.09 
 
 
268 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.291214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  41.09 
 
 
263 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  39.61 
 
 
256 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0783  hydrolase, putative  41.57 
 
 
275 aa  203  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  39.22 
 
 
255 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  39.22 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  38.82 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  38.82 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.82 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  38.82 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  40.47 
 
 
256 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  38.82 
 
 
255 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.82 
 
 
255 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  38.43 
 
 
255 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  37.65 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  38.04 
 
 
255 aa  194  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 
255 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  36.47 
 
 
255 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 
257 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  37.98 
 
 
256 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  38.52 
 
 
251 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  36.76 
 
 
256 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.65 
 
 
464 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 
256 aa  176  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  37.65 
 
 
256 aa  176  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  34.51 
 
 
263 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  37.07 
 
 
262 aa  175  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 
269 aa  174  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  36.82 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  36.82 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  37.89 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 
257 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  36.29 
 
 
261 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.73 
 
 
256 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  35.02 
 
 
255 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  35.04 
 
 
258 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  36.86 
 
 
263 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  36.33 
 
 
264 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  33.33 
 
 
257 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  32.95 
 
 
273 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  32.68 
 
 
462 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  33.59 
 
 
606 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  35.29 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.8 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  31.91 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  31.4 
 
 
458 aa  161  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  32.68 
 
 
462 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  31.52 
 
 
255 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  31.4 
 
 
458 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  32.02 
 
 
255 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  35.18 
 
 
258 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.04 
 
 
256 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  34.72 
 
 
271 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  33.6 
 
 
271 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  33.2 
 
 
253 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  34.25 
 
 
256 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 
273 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  30.47 
 
 
461 aa  158  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  34.11 
 
 
265 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 
253 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  31.64 
 
 
459 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  33.85 
 
 
258 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 
457 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  34.9 
 
 
253 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  33.72 
 
 
262 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  31.8 
 
 
264 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  33.98 
 
 
256 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  34.47 
 
 
267 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  32.55 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.92 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  33.72 
 
 
263 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  36.36 
 
 
258 aa  155  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  30.71 
 
 
268 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 
259 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  34.12 
 
 
262 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  35 
 
 
266 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  33.86 
 
 
263 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  33.47 
 
 
265 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  33.46 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  30.74 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  32.68 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  32.81 
 
 
261 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  32.53 
 
 
263 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  29.96 
 
 
258 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  30.62 
 
 
262 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
264 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>