More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1278 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  100 
 
 
259 aa  537  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  68.9 
 
 
255 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  68.77 
 
 
253 aa  371  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  57.48 
 
 
255 aa  298  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  48.59 
 
 
256 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  47.41 
 
 
256 aa  265  4e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  47.22 
 
 
261 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  45.85 
 
 
253 aa  255  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  45.45 
 
 
254 aa  254  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5476  hydrolase, TatD family  45.42 
 
 
256 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230382  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  43.7 
 
 
265 aa  245  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  45.06 
 
 
255 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.7 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2234  hydrolase, TatD family  43.08 
 
 
268 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.291214 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  42.75 
 
 
255 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  42.75 
 
 
255 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.75 
 
 
255 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.75 
 
 
255 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  41.96 
 
 
255 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.96 
 
 
255 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  41.96 
 
 
255 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  41.96 
 
 
255 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  41.18 
 
 
255 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0783  hydrolase, putative  42.91 
 
 
275 aa  206  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.57 
 
 
255 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  40.39 
 
 
255 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  41.18 
 
 
256 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  43.53 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  39.22 
 
 
256 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  38.34 
 
 
255 aa  195  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  37.65 
 
 
255 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.11 
 
 
462 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.5 
 
 
606 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  38.28 
 
 
257 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  38.28 
 
 
257 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  38.28 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  39.77 
 
 
262 aa  181  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35.55 
 
 
458 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 
458 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.22 
 
 
462 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35 
 
 
464 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.05 
 
 
457 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  33.73 
 
 
263 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  33.83 
 
 
461 aa  175  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.08 
 
 
256 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  37.08 
 
 
269 aa  175  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  36.47 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  37.01 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  35.14 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  36.19 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  36.86 
 
 
255 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  34.4 
 
 
255 aa  171  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  37.25 
 
 
260 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  34.9 
 
 
256 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  35.71 
 
 
256 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  33.6 
 
 
268 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.29 
 
 
256 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  34.78 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.29 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  35.69 
 
 
258 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  34.8 
 
 
255 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  34.63 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  36.11 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  34.11 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  35.27 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  33.73 
 
 
257 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  35.6 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  35.43 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  34.23 
 
 
258 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  35.27 
 
 
263 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  35 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  33.2 
 
 
252 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  33.73 
 
 
259 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  33.2 
 
 
253 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  33.73 
 
 
257 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 
267 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 
266 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  34.88 
 
 
267 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  33.46 
 
 
271 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  37.69 
 
 
271 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 
254 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  31.32 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
273 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  34.62 
 
 
260 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  37.69 
 
 
271 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  37.69 
 
 
271 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 
262 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  31.08 
 
 
268 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  35.18 
 
 
263 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  35.04 
 
 
253 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  34.5 
 
 
263 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  33.07 
 
 
258 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  32.94 
 
 
258 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0103  TatD family hydrolase  32.18 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0970628  normal  0.125784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  30.62 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  30.62 
 
 
258 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  29.55 
 
 
262 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  30.98 
 
 
258 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>