More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5476 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5476  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 256 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2234  hydrolase, TatD family  59.85 
 
 		 268 aa  308  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.291214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  52.8 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  52.99 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  53.17 
 
 		 253 aa  285  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  51.59 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  49 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  47.41 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  48.21 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  47.81 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  46.22 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  45.42 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  42.63 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  38.67 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  36.76 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 462 aa  178  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  36.11 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  38.74 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  36.11 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  36.51 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.36 
 
 		 606 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  35.71 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  36.08 
 
 		 462 aa  168  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  35.71 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  35.71 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 		 458 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.71 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.71 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0783  hydrolase, putative  36.84 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  35.71 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.71 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35.97 
 
 		 458 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  34.75 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  38.19 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.27 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  35.32 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.32 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  36.95 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.76 
 
 		 457 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  37.65 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  35.02 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 461 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  34.13 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  34.12 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  32.54 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.94 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  33.59 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  34.4 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  34.13 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  29.76 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  33.6 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  33.85 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  35.32 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  32.82 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  33.6 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  33.73 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  33.73 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  36.69 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  30.71 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  32.82 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  31.76 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  32.66 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  32.49 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  32.82 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  32.82 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  32.81 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  31.87 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  32.95 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  32.41 
 
 		 464 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  33.84 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  30.83 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  34.26 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  30.89 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  31.25 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  31.35 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  31.8 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  30.47 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  30.43 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  33.2 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  32.44 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  32.66 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  32.82 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  31.35 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  33.07 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  32.81 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  34.13 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  30.16 
 
 		 459 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  34.51 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  36.51 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  32.57 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  32.03 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  31.92 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  30.98 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>