More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2570 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  56.69 
 
 		 255 aa  261  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  51.18 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  48.83 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  46.64 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  43.75 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  46.48 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  46.01 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  44.84 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  45.24 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  44.84 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  41.31 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  44.08 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  45.45 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  44.49 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  44.9 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  39.37 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  40.16 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  46.97 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  45.31 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  43.48 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  42.49 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  45.31 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  45.31 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  45.31 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  43.31 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  43.31 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  43.31 
 
 		 257 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  43.31 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  43.31 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  36.51 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  39.76 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  47.62 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  39.15 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  44 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  39.76 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  39.76 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  39.92 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  39.22 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  39.22 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  39.22 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  42.21 
 
 		 286 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  42.19 
 
 		 270 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  38.49 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  42.19 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  44.9 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  38.74 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  39.58 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  39.11 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  40.87 
 
 		 258 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  43.27 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  44.9 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  38.46 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  44.9 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  46.39 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  44.9 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  44.9 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  44.9 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  41.27 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  39.55 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  46.01 
 
 		 281 aa  165  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  44.49 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  44.08 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  44.49 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  39.76 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  38.61 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  49.53 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  38.89 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  38.52 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  48.86 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  40.22 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  36.11 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  34.2 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  39.17 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  40.23 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.04 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  41.95 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  40.23 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  38.53 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  37.16 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  43.89 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  35.29 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  37.93 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  40.97 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  41.07 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  41.07 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2017  TatD-related deoxyribonuclease  44.71 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2387  hydrolase, TatD family  44.71 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  38.05 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  34.9 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1521  Sec-independent protein translocase TatD  36.15 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0926881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  39.64 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>