More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2387 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2017  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 271 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2387  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  48.21 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  44.84 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  49.02 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  44.71 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  49.8 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  44.71 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  40.56 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  41.25 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  39.29 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  41.37 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  39.04 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  40.8 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  40.78 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  39.3 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  43.68 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  39.53 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  40.78 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  38.67 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  36.43 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  35.04 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  38.82 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  36.86 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  34.9 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  37.65 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  37.65 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  34.65 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  34.9 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.9 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  34.26 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  37.65 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  39.33 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  41.22 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  38.28 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  37.01 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.32 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  37.01 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  37.01 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  37.01 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  40.77 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  37.89 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.9 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  36.61 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.51 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.73 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  36.47 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  36.61 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  42.21 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  36.86 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  34.13 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  36.08 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  38.19 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.47 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  36.14 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  35.16 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  35.16 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  36.08 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  33.46 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  33.71 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  37.6 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.04 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  37.6 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  37.65 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  37.65 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  35.04 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 278 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  36.95 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  36.58 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.14 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  31.75 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  35.66 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  35.32 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  37.25 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  35.04 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  35.04 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  36.9 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  37.35 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  37.35 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  32.94 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  33.33 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  37.7 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  36.68 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>