More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2645 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 256 aa  513  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  70.24 
 
 		 255 aa  358  6e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  65.48 
 
 		 260 aa  345  5e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  64.29 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  60.87 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  51.18 
 
 		 260 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  48.8 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  48.82 
 
 		 259 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  47.64 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  49.61 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  47.45 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  43.7 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  45.63 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  47.69 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  45.34 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  42.8 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  43.92 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  44.49 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  44.13 
 
 		 262 aa  204  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  43.72 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  43.8 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  38.19 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  44.13 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  43.41 
 
 		 270 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  43.2 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  45.34 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  45.34 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  45.34 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  45.34 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  46.06 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  46.06 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  40.08 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  42.64 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  46.19 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  44.13 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  44.13 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  44.13 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  44.13 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  44.13 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  42.29 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  43.72 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  43.72 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  39.04 
 
 		 259 aa  188  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  42.48 
 
 		 286 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  43.8 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  39.3 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  37.3 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  37.6 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  40.62 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  40.62 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  38.7 
 
 		 278 aa  178  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  41.11 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  38.58 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  42.22 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  39.15 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  45.56 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  44.7 
 
 		 293 aa  174  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  40.22 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  37.9 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  39.22 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  37.15 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  37.7 
 
 		 290 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  38.37 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  37.25 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  35.04 
 
 		 253 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  38.82 
 
 		 260 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.43 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  36.86 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  38.43 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  38.13 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  38.43 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  37.86 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  38.43 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  37.35 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  40.22 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  38.19 
 
 		 252 aa  168  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  38.93 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  41.41 
 
 		 272 aa  168  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  39.68 
 
 		 278 aa  168  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  35.97 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  34.65 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  34.65 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.65 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  41.47 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  38.28 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2017  TatD-related deoxyribonuclease  49.02 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.65 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  38.28 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2387  hydrolase, TatD family  48.03 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  38.89 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.25 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  34.25 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.25 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>