More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3146 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  47.22 
 
 		 259 aa  234  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  47.22 
 
 		 259 aa  234  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  47.22 
 
 		 259 aa  234  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  47.18 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  46.83 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  46.43 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  46.43 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  46.03 
 
 		 260 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  47.58 
 
 		 260 aa  230  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  43.53 
 
 		 265 aa  225  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  44.76 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  43.72 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  44.98 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  42.46 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  44.71 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 265 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  42.86 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  42.86 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  42.86 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  40.78 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  42.86 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  42.86 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  42.06 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  40.73 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  44.49 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  42.51 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  42.26 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  44.53 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  42.91 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  43.31 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  44.62 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  41.13 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  43.63 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  43.82 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  42.91 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  44.26 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  40.55 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  40.55 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  42.62 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  40.68 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  41.77 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  39.36 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  41.77 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  39.02 
 
 		 278 aa  184  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  37 
 
 		 280 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  42.19 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  42.74 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  42.74 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  42.74 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  40.25 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  42.49 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  38.71 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  38.75 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  39.32 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  37.3 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  40.51 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  41.54 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  35.74 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  37.74 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  43.05 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  38.14 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  35.98 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  39.57 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  44.59 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  35.98 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 288 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  44.16 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  39.74 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  39.74 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  39.74 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  39.74 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  39.74 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  38.82 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  42.25 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  40.73 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  39.32 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  39.32 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  36.93 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  39.32 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  39.32 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  38.31 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  38.89 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  37.73 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  34.85 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  33.6 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  39.32 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  39.32 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  39.32 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  36.55 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  38.86 
 
 		 271 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  38.72 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  41.2 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  39.15 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  37.34 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  35.04 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  34.12 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>