More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5965 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 262 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  99.62 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 262 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  91.6 
 
 		 262 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  90.84 
 
 		 262 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  90.46 
 
 		 262 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  90.46 
 
 		 262 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  83.59 
 
 		 262 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  76.72 
 
 		 262 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  84.73 
 
 		 262 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  84.73 
 
 		 262 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  85.11 
 
 		 262 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  84.73 
 
 		 262 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  85.11 
 
 		 262 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  84.73 
 
 		 262 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  84.73 
 
 		 262 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  75.57 
 
 		 262 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  75.57 
 
 		 262 aa  357  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  62.64 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  61.65 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  56.6 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  56.23 
 
 		 270 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  59.42 
 
 		 281 aa  299  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  59.42 
 
 		 279 aa  298  8e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  59.18 
 
 		 284 aa  298  9e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  58.65 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  55.72 
 
 		 286 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  54.38 
 
 		 282 aa  278  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  54.61 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  56.03 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  58.96 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  56.82 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  56.93 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  49.26 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  54.86 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  49.47 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  51.48 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  51.03 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  50.79 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  54.22 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  47.39 
 
 		 259 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  45.38 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  44.58 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  42.57 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  45.6 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  44.58 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  42.97 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  44.18 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  43.78 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  45.56 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  41.31 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  45.87 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  41.38 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  41.94 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  37.35 
 
 		 263 aa  185  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  40.31 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  38.58 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  45.14 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  39.11 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  38.58 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  39.92 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  39.51 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  39.51 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  38.58 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  38.98 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  39.51 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  38.1 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  38.49 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  36.08 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  36.58 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 254 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  40 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  40 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  38.31 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  40 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  40 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  40 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  41.53 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  36.71 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  37.84 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  38.81 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  37.84 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  34.92 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  39.09 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  41.5 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  37.67 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  37.67 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  38.22 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  40.32 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  37.75 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  37.84 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  37.29 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>