More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02995 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  100 
 
 		 280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  39.19 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  37.09 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  38.49 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  37 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  40.64 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  35.48 
 
 		 290 aa  175  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  34.78 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  35.51 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  33.58 
 
 		 257 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  35.14 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  34.78 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  34.78 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  34.78 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  34.78 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  34.78 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  34.78 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  35.38 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  33.94 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  34.31 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  32.97 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  33.57 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  33.57 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  33.57 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  33.57 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  33.57 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  34.78 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  35.87 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  35.51 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  35.14 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  29.56 
 
 		 263 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  33.7 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  32.12 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  31.88 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  30.29 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  31.64 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  35.48 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  34.42 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  33.09 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  33.09 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  34.42 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  34.42 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  34.42 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  31.05 
 
 		 272 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  35.48 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  31.87 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  33.09 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  30.43 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.29 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  30.82 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  30.11 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  31.05 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  30.82 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  32.25 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  30.8 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  30.6 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  30.66 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  31.54 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  31.16 
 
 		 258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  29.6 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  30.47 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  30.22 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  30.94 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  29.86 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  29.86 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  30.22 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  29.86 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.86 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  32.01 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  31.05 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  32 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  29.86 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  30.66 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.86 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  30.8 
 
 		 254 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  32.73 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.35 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  33.8 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  31.05 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  30.82 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  30.58 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  29.71 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  29.5 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  30.32 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  36.53 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  32.74 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  31.18 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  29.35 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  32.01 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  31.8 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  30.69 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  30.69 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  29.75 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  36 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  31.9 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  28.78 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  30.6 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>