More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1466 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  76.95 
 
 		 244 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  49.3 
 
 		 286 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  49.26 
 
 		 262 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  49.82 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  52.24 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  48.91 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  48.13 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  51.02 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  50 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  50.4 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  51.2 
 
 		 262 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  51.2 
 
 		 262 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  47.37 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  51.2 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  51.2 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  51.2 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  51.2 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  51.2 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  48.23 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  48.28 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  48.23 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  46.55 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  49.63 
 
 		 293 aa  241  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  49.6 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  46.91 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  50.61 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  50.2 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  50.2 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  50.2 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 268 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  49.19 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  50.55 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  49.27 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  46.26 
 
 		 282 aa  228  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  48.71 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  47.43 
 
 		 271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  49.62 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  46.74 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  46.54 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  40 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  41.92 
 
 		 259 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  39.02 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  40.23 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  44.06 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  40.77 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  38.87 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  39.54 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  39.23 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  37.69 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  35.93 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  38.46 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  36.23 
 
 		 259 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  34.98 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  40.38 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  38.7 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  36.5 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  36.5 
 
 		 260 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  40.74 
 
 		 260 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  37.36 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  38.61 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  36.5 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  36.5 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  35.91 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  39.62 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  36.5 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  35.8 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  41.95 
 
 		 232 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  36.4 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  36.4 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  36.68 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  36.4 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  36.4 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  36.4 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  39.71 
 
 		 225 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  34.38 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  35.74 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  37.74 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  38.55 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  34.98 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  34.6 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  35.91 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  34.11 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  35.61 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  32.55 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  34.52 
 
 		 243 aa  149  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  34.88 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  33.21 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  39.84 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  39.84 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  33.58 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  31.56 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  31.95 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1087  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 264 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3606  TatD family hydrolase  38.26 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000130951  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  35.27 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>