More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1087 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1087  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  42.8 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  42 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  41.87 
 
 		 263 aa  175  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  39.27 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  41.18 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  39.92 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  41.2 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  41.38 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  39.48 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  40.49 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  39.27 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  39.37 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  36.19 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  40.94 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  38.41 
 
 		 287 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  39.68 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  43.65 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  37.77 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  36.7 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  39.27 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  38.4 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  38.62 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.94 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  40.64 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  38.4 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  33.47 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  37.35 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  37.35 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  41.18 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  40.84 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  38.62 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  35.63 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  40.81 
 
 		 281 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  34.78 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  39.76 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  35.48 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  39.29 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  34.75 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 293 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  37.68 
 
 		 283 aa  148  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  38.35 
 
 		 282 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  31.8 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  31.8 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.8 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.8 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  38.62 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.8 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  30.12 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  38.62 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  36.14 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  43.94 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  38.62 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  37.73 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  38 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  37.34 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  35.34 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  31.42 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  36.99 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  36.76 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  33.21 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  31.03 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  31.42 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  33.07 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  39.43 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  39.43 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.18 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  39.43 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  39.43 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  39.43 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  33.21 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  32.54 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.42 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  37.77 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  37.77 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  35.89 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  33.59 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  33.59 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  38.36 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  30.8 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  37.77 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  39.02 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  39.02 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  38.36 
 
 		 257 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  38.36 
 
 		 257 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  33.73 
 
 		 283 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  32.14 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  33.87 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  37.18 
 
 		 290 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  32.02 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  34.68 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  31.37 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.54 
 
 		 462 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  34.94 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  37.93 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  34 
 
 		 606 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  34.24 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>