More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3243 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  77.27 
 
 		 287 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  64.94 
 
 		 283 aa  347  9e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  62.5 
 
 		 286 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  63.25 
 
 		 281 aa  322  6e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  62.9 
 
 		 279 aa  318  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  61.4 
 
 		 288 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  59.78 
 
 		 284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  62.5 
 
 		 273 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  59.86 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  54.74 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  55.68 
 
 		 262 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  56.83 
 
 		 282 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  53.79 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  55.68 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  53.79 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  53.79 
 
 		 262 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  53.79 
 
 		 262 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  53.41 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  52.92 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 270 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  54.17 
 
 		 262 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  52.27 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  54.17 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  54.17 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  54.17 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  54.17 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  54.17 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  54.17 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  54.17 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  53.79 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  50.71 
 
 		 268 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  52.55 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  49.46 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  46.26 
 
 		 278 aa  228  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  50.92 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  49.08 
 
 		 263 aa  214  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  50.37 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  41.85 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  41.61 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  38.71 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  38.21 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  41.11 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  38.69 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  38.32 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  43.96 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  38.21 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  39.05 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  39.05 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  41.09 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  39.05 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  38.35 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  41.11 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  40.51 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  40.07 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  37.64 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  35.9 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  39.63 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  38.32 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  38.32 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  38.32 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  37.73 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  38.32 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  38.32 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  39.26 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  35.79 
 
 		 260 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  36.13 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  41.11 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  41.11 
 
 		 258 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  37.96 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  34.69 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  34.69 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  35.56 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  37.77 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  39.05 
 
 		 256 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  35.23 
 
 		 281 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  34.07 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  37.73 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  38.15 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  34.18 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  34.07 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  40.44 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  32.1 
 
 		 273 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  36.69 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  34.19 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.04 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  34.07 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  35.25 
 
 		 265 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  38.24 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  34.07 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  34.44 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  35.4 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  35.9 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  36.53 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  38.66 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  33.7 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>