More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1889 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  100 
 
 
262 aa  526  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  94.66 
 
 
262 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  94.66 
 
 
262 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  94.66 
 
 
262 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  94.66 
 
 
262 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  94.66 
 
 
262 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  94.27 
 
 
262 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  94.27 
 
 
262 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  84.35 
 
 
262 aa  420  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  83.21 
 
 
262 aa  410  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  82.06 
 
 
262 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  83.59 
 
 
262 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  83.59 
 
 
262 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  83.59 
 
 
262 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  82.82 
 
 
262 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  72.14 
 
 
262 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  71.37 
 
 
262 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  72.14 
 
 
262 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  61.89 
 
 
277 aa  316  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  61.28 
 
 
275 aa  295  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  56.18 
 
 
284 aa  294  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  59.49 
 
 
281 aa  292  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  59.12 
 
 
279 aa  291  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  55.47 
 
 
270 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  55.47 
 
 
270 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  56.09 
 
 
286 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  57.14 
 
 
271 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  55.88 
 
 
288 aa  275  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  57.3 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  52.92 
 
 
282 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  57.46 
 
 
273 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 
278 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  56.44 
 
 
293 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  53.52 
 
 
268 aa  254  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  49.82 
 
 
287 aa  254  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  50.21 
 
 
244 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  51.85 
 
 
283 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  52.14 
 
 
253 aa  234  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  49.21 
 
 
263 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  45.78 
 
 
259 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  50.2 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  43.78 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  43.78 
 
 
258 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  42.17 
 
 
259 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  42.31 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  41.7 
 
 
264 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 
259 aa  194  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  41.77 
 
 
258 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  44 
 
 
256 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  42.57 
 
 
258 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  41.77 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  36.95 
 
 
263 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  44.35 
 
 
260 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 
265 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  41.28 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  40.43 
 
 
260 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  43.58 
 
 
225 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  39.2 
 
 
259 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  39.2 
 
 
259 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  39.92 
 
 
255 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  39.2 
 
 
259 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  40.43 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  38.03 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  40.85 
 
 
260 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  40 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 
256 aa  178  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  40.43 
 
 
260 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  38.1 
 
 
257 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  38.1 
 
 
257 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  39.15 
 
 
257 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  38.1 
 
 
257 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  38.1 
 
 
257 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  38.1 
 
 
257 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  38.31 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  39.02 
 
 
260 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  34.24 
 
 
259 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  41.13 
 
 
263 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  37.94 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  38.74 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  36.58 
 
 
290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  37.94 
 
 
255 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  38.31 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  37.94 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  40.85 
 
 
278 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  37.18 
 
 
257 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  39.82 
 
 
254 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 
254 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  38.81 
 
 
232 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  37.6 
 
 
254 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  38.31 
 
 
267 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  36.61 
 
 
259 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  35.02 
 
 
267 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  34.4 
 
 
257 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  36.33 
 
 
283 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.01 
 
 
267 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  37.2 
 
 
254 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  39.23 
 
 
251 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  35.83 
 
 
259 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  35.86 
 
 
254 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>