More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3221 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 283 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  65.73 
 
 		 287 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  64.54 
 
 		 282 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  63.25 
 
 		 286 aa  345  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  64.79 
 
 		 281 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  64.08 
 
 		 279 aa  332  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  65.61 
 
 		 288 aa  321  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  58.84 
 
 		 284 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  62.9 
 
 		 273 aa  291  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  58.63 
 
 		 282 aa  278  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  59.29 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  53.38 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  53.01 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  50.36 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  50.36 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  52.63 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  51.13 
 
 		 262 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  51.13 
 
 		 262 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  51.13 
 
 		 262 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  51.88 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  50.35 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  51.88 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  51.88 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  51.88 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  51.88 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  51.88 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  51.88 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  51.5 
 
 		 262 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  50.75 
 
 		 262 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  51.07 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  49.1 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  49.47 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  50.53 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  50.56 
 
 		 262 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  46.38 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  50.77 
 
 		 244 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  48.71 
 
 		 256 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  46.74 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  45.99 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  44.2 
 
 		 255 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  41.82 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  41.84 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  41.18 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  40.15 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  42.32 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  39.26 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  40.07 
 
 		 259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  40.07 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  40.15 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  40.15 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  40.15 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  39.41 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  39.41 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  40.14 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  40.07 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  39.03 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  39.41 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  36.03 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  39.7 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  38.95 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  39.03 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  40.29 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  41.95 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  38.29 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  37.92 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  36.94 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  42.11 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  42.18 
 
 		 232 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  38.52 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  38.52 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  38.52 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  38.52 
 
 		 257 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  43.48 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  38.52 
 
 		 257 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  41.7 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  37.17 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  40.07 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  37.23 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  37.32 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  39.39 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  36.13 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  33.95 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1087  TatD-related deoxyribonuclease  38.13 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  37.83 
 
 		 255 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  37.59 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  31.42 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  37.41 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  33.57 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  31.09 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  31.09 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.56 
 
 		 256 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.08 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  39.01 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  32.96 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  32.96 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.96 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  39.01 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  39.01 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>