More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2473 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
263 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  43.08 
 
 
258 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  41.9 
 
 
260 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  42.97 
 
 
257 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  41.5 
 
 
260 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  41.9 
 
 
260 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  41.5 
 
 
260 aa  205  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  41.96 
 
 
265 aa  205  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  41.5 
 
 
260 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  41.11 
 
 
260 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  41.5 
 
 
259 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  41.5 
 
 
259 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  41.5 
 
 
259 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  40.55 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  42.13 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  39.45 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  42.13 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  42.13 
 
 
257 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  42.13 
 
 
257 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  42.13 
 
 
257 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  42.86 
 
 
283 aa  198  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  41.9 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  41.13 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  41.34 
 
 
290 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  40.48 
 
 
257 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  38.28 
 
 
263 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  38.1 
 
 
255 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  35.18 
 
 
257 aa  185  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  41.41 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  40.08 
 
 
243 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  40.86 
 
 
278 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  40.08 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  37.89 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  41.7 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  40.32 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  39.3 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  38.52 
 
 
258 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  31.54 
 
 
300 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  40.68 
 
 
262 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  33.86 
 
 
263 aa  168  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  39.69 
 
 
269 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 
269 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  35.18 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  42.31 
 
 
262 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  41.47 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 
270 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  36.22 
 
 
254 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  34.78 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  39.31 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  40.7 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  36.19 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 
270 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  34.11 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  33.99 
 
 
254 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  34.51 
 
 
256 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  33.99 
 
 
255 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  33.99 
 
 
255 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  33.99 
 
 
255 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  38.89 
 
 
262 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  35.43 
 
 
255 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  34.36 
 
 
276 aa  158  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  40.43 
 
 
262 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  31.75 
 
 
259 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  40.43 
 
 
262 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  40.43 
 
 
262 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  40.43 
 
 
262 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  40.43 
 
 
262 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  40.43 
 
 
262 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  33.98 
 
 
254 aa  155  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  40.43 
 
 
262 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  38.49 
 
 
255 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  37.16 
 
 
260 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  40.33 
 
 
262 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  38.14 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  39.42 
 
 
262 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  34.92 
 
 
260 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  35.02 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  38.3 
 
 
262 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  38.3 
 
 
262 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  38.3 
 
 
262 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  38.3 
 
 
262 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  35.91 
 
 
278 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  39.27 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  39.91 
 
 
225 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  36.63 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  39 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  38.87 
 
 
288 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  39.55 
 
 
293 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  29.56 
 
 
280 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  38.39 
 
 
232 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  36.19 
 
 
253 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  31.94 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  34.24 
 
 
277 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  39.32 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  33.07 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3175  TatD-related deoxyribonuclease  34.11 
 
 
275 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  34.52 
 
 
260 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0999  TatD-related deoxyribonuclease  31.62 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000160958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  36.6 
 
 
281 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  36.64 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>