More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0133 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 260 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  93.85 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  64.54 
 
 		 255 aa  334  7.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  64.29 
 
 		 256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  50.79 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  43.92 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  43.53 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  42.8 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  41.18 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  42.02 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  42.63 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  40.96 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  41.18 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  37.6 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  39.2 
 
 		 263 aa  185  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  39.22 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  43.05 
 
 		 225 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  38.91 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  36.96 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  39.83 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  36.9 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  39.53 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  37.21 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  38.43 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  40.86 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  37.1 
 
 		 262 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  38.28 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  38.31 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  40.47 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  37.89 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  38.52 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  38.28 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  40.47 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  39.06 
 
 		 262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  38.04 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  35.83 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  34.51 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  37.7 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  36.47 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  34.12 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  38.49 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  40.39 
 
 		 258 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  36.54 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  39.45 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  35.94 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  37.65 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  37.65 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  36.72 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  37.65 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  35.46 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.73 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  39.45 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  35.91 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  37.94 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  33.73 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  33.73 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  37.02 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.73 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  36.4 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.73 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  37.11 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  34.6 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  38.11 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  33.73 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  38.11 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  38.11 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  39.61 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  36.29 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  39.06 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  38.7 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  38.28 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  39.41 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  33.33 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  39.06 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  34.9 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  36.11 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  39.91 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  35.23 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  39.91 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  35.23 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  39.91 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  39.91 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  39.91 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2017  TatD-related deoxyribonuclease  44.71 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  34.65 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  36.19 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2387  hydrolase, TatD family  44.71 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  36.19 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  36.25 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>