More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1914 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
268 aa  545  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  61.96 
 
 
253 aa  281  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  59.38 
 
 
262 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  60.63 
 
 
256 aa  276  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  52.83 
 
 
270 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  54.85 
 
 
284 aa  265  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  52.83 
 
 
270 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  58.13 
 
 
262 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  56.5 
 
 
262 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  55.69 
 
 
262 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  51.44 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  57.62 
 
 
293 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  55.11 
 
 
281 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  54.32 
 
 
282 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  54.74 
 
 
279 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  56.1 
 
 
262 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  56.1 
 
 
262 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  59.15 
 
 
262 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  56.1 
 
 
262 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  56.91 
 
 
262 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  53.62 
 
 
288 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  53.25 
 
 
262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  52.47 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  49.65 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  50.71 
 
 
282 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  53.97 
 
 
263 aa  240  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  55.28 
 
 
262 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  55.28 
 
 
262 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  55.28 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  54.36 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  55.28 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  55.28 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  55.28 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  55.28 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  55.68 
 
 
273 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  58.3 
 
 
262 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  52.04 
 
 
271 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  50.74 
 
 
283 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  51.89 
 
 
275 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  47.06 
 
 
258 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  45.7 
 
 
258 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  46.18 
 
 
255 aa  208  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  46.41 
 
 
260 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  43.7 
 
 
260 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  45.83 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  45.99 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  43.14 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  45.99 
 
 
260 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  43.58 
 
 
257 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.707092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  46.41 
 
 
259 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  46.41 
 
 
259 aa  198  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  46.41 
 
 
259 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  42.35 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  41.77 
 
 
260 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  44.14 
 
 
259 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  43.63 
 
 
256 aa  195  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  45.57 
 
 
260 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  42.91 
 
 
265 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  45.63 
 
 
256 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  42.91 
 
 
265 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  41.96 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  41.86 
 
 
257 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  41.86 
 
 
257 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  41.86 
 
 
257 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  42.19 
 
 
259 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  41.47 
 
 
257 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  41.47 
 
 
257 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  42.41 
 
 
290 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  40.96 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  40.16 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  43.36 
 
 
283 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  43.92 
 
 
258 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  38.4 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  43.48 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  43.14 
 
 
258 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 
259 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  43.05 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  44.98 
 
 
255 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  41.47 
 
 
251 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  38.15 
 
 
267 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  40.87 
 
 
255 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  43.88 
 
 
278 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  38.89 
 
 
263 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  37.7 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  40.18 
 
 
232 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  40.38 
 
 
262 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  40.38 
 
 
269 aa  164  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  40.38 
 
 
269 aa  164  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  39.06 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
258 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  36.51 
 
 
254 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  39.45 
 
 
252 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  40.25 
 
 
261 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  39.6 
 
 
257 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  36.51 
 
 
255 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  35.16 
 
 
255 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  34.26 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  36.15 
 
 
255 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1087  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 
252 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.274237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>