More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03379 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  77.43 
 
 		 257 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  53.12 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  50.2 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  46.67 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  47.83 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  46.85 
 
 		 290 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  45.88 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  45.49 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  43.08 
 
 		 267 aa  228  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  46.25 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  45.49 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  45.49 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  44.14 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  44.27 
 
 		 257 aa  225  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  45.49 
 
 		 259 aa  225  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  45.49 
 
 		 259 aa  225  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  45.49 
 
 		 259 aa  225  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  44.27 
 
 		 257 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  44.27 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  44.27 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  43.75 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  43.87 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  45.1 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  46.03 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  43.7 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  43.15 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  40.64 
 
 		 280 aa  188  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  43.25 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  43.25 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  43.25 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 		 263 aa  185  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  39.3 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  38.98 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  36.72 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  37.89 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  33.11 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  37.01 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  36.72 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  37.01 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  39.6 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  36.22 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  36.22 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  35.83 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  33.99 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  36.96 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  33.73 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  35.94 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  39.41 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  35.94 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  34.96 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  39.41 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  34.52 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  37.16 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  37.93 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  39.15 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  38.98 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  34.39 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  34.88 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  37.3 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  37.08 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  38.84 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  40.87 
 
 		 271 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  38.3 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  36.74 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  35.47 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  36.56 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  39.5 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  37.86 
 
 		 276 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  32.3 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  32.41 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  35.39 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  31.76 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  36.09 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  35.23 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  31.44 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  38.84 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  31.44 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  34.27 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  37.08 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  37.08 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  37.08 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  37.28 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  37.28 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  38.3 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  38.22 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  34.22 
 
 		 277 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  38.3 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  37.28 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  37.28 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>