More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0239 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  100 
 
 		 243 aa  507  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  53.39 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  52.54 
 
 		 265 aa  248  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  51.9 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  51.9 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  51.9 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  51.9 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  51.9 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  51.48 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  51.48 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  51.48 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  51.48 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  47.3 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  50.42 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  50.42 
 
 		 260 aa  225  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  51.26 
 
 		 260 aa  225  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  50.42 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  51.05 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  48.31 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  50.87 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  41.6 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  41 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  43.33 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  44.35 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  48.48 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  48.05 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  48.05 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  36.93 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  36.63 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  37.04 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  37.08 
 
 		 267 aa  154  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  31.79 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  34.3 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  34.3 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  35.95 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  32.23 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  34.52 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  34.16 
 
 		 258 aa  148  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  34.8 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  35.09 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  34.91 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  36.51 
 
 		 258 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  33.19 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  33.77 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  33.88 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  33.9 
 
 		 255 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  32.37 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  32.37 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  32.5 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  33.61 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  33.63 
 
 		 260 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  32.78 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  37.26 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  32.78 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  44.65 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  32.22 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  32.78 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  31.56 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  44.03 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  41.15 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  36.63 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  30.74 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  38.86 
 
 		 296 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  36.53 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  30.99 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  32.22 
 
 		 278 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  34.4 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  34.78 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  31.45 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  35 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  34.55 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  30.64 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  34.56 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  36.7 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  31.02 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1953  TatD-related deoxyribonuclease  31.64 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.884488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  33.05 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  36.41 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  36.67 
 
 		 282 aa  118  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  35.65 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  34.29 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  34.29 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  34.29 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  31.71 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  34.29 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  35.07 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  34.29 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  34.29 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  34.29 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  32.37 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  35.07 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  35.07 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  32.11 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  35.19 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  37.44 
 
 		 293 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  28.63 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>