More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2818 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  48.85 
 
 		 278 aa  261  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  48.84 
 
 		 254 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  48.84 
 
 		 254 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  50.78 
 
 		 263 aa  255  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  48.84 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  47.67 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  47.29 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  47.67 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  45.77 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  44.96 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  44.96 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  44.96 
 
 		 255 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  45.56 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0999  TatD-related deoxyribonuclease  45.74 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000160958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0970  TatD-related deoxyribonuclease  48.46 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0121971  decreased coverage  0.000171959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  36.54 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  34.36 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  35.25 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  32.32 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  41.06 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  39.41 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  37.38 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  37.38 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  38.24 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  35.46 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  34.94 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  38.24 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  34.34 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  37.75 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  38.16 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  37.75 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  32.43 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  32.43 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  31.91 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  32.43 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  32.43 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  32.05 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  32.43 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  32.43 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  32.43 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  32.05 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  32.43 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  33.72 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  38.24 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  37.25 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  39.05 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  38.76 
 
 		 263 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  41.38 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  37.68 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  35.78 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  35.29 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  38.35 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  34.8 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  37.86 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  37.2 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  32.44 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  35.29 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  37.74 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  33.21 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  39.22 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  39.22 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  35.78 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  39.22 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  39.22 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  39.22 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  37.26 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  36.76 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  31.13 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  33.2 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  37.75 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  33.2 
 
 		 269 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 269 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  38.73 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  38.73 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  31.88 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.19 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  38.65 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  34.76 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  38.16 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  37.32 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  36 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  31.58 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  34.78 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  34.27 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  35.21 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  32.17 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  37.38 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  29.89 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  33.02 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  38.57 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>