More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2825 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 254 aa  526  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  79.92 
 
 		 254 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  79.53 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  79.53 
 
 		 254 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  79.53 
 
 		 254 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  77.17 
 
 		 255 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  75.59 
 
 		 256 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  75.59 
 
 		 255 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  75.2 
 
 		 255 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  57.48 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  55.12 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  49.21 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  53.73 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0999  TatD-related deoxyribonuclease  50.59 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000160958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  47.29 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0970  TatD-related deoxyribonuclease  51.18 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0121971  decreased coverage  0.000171959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  42.97 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  40.55 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  38.98 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  36.61 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  38.67 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  40.51 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  38.19 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  36.55 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  36.47 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  37.35 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  37.35 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  37.35 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  37.65 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 290 aa  168  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  35.04 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  36.19 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  36.72 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  35.55 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  36.19 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  36.19 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  36.19 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  36.72 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  37.35 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  36.19 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  36.58 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  36.64 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  36.33 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.27 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.27 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  35.04 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  36.33 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  36.22 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  33.85 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.82 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  35.63 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  36.72 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  36.58 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  38.03 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  33.98 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  39.39 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  35.94 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  35.22 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  36.36 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  38.46 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  39.09 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  38.29 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  39.09 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  39.09 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  38.82 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  36.29 
 
 		 293 aa  151  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  34.51 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  37.11 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  38.32 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  37.27 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  38.13 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  38.28 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  38.13 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  38.13 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  36.4 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  33 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  38.72 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  38.18 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  38.29 
 
 		 225 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.56 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  35.69 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 277 aa  144  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  34.5 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  36.16 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  36.13 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  34.12 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  34.63 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  37.18 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  37.18 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  35.5 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  33.7 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>