More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1829 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  46.64 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  42.63 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  42.26 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  35.77 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  37.89 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  43.31 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  42.13 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  42.52 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  43.14 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  39.45 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  38.1 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  39.53 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  39.53 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  39.45 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  39.53 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  38.37 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  42.35 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  39.59 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  38.19 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  39.59 
 
 		 260 aa  181  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  38.91 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  37.94 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  39.69 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  40.94 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  39.69 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  39.69 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  39.69 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  39.69 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  39.59 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  36.61 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  37.3 
 
 		 257 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  37.01 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  43.48 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  37.35 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  36.22 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  38.1 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  36.22 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  37.01 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  34.12 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  37.01 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  41.3 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  35.04 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  38.91 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  40.87 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  35.18 
 
 		 267 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  40 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  38.82 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  41.41 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  41.74 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  41.32 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  33.73 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  42.79 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  32.97 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  38.19 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  38.19 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  38.19 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  31.76 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  39.41 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  37.67 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  35.66 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  43.24 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  38.15 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  38.15 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  32.16 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  39.56 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  40.17 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  40.39 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  40.39 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  39.75 
 
 		 293 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  34.8 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  38.26 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  36.33 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  30.47 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  33.73 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  29.53 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  36.29 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  38.71 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  32.17 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  38.4 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  38.02 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  33.19 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  30.77 
 
 		 264 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  40.6 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  40.6 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  40.6 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  32.82 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  40.6 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.02 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0970  TatD-related deoxyribonuclease  33.72 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0121971  decreased coverage  0.000171959 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  40.6 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  37.35 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  37.98 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  29.3 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.29 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>