More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1078 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  78.47 
 
 
275 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  63.1 
 
 
270 aa  341  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  66.05 
 
 
271 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  61.99 
 
 
270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  61.19 
 
 
262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  62.15 
 
 
262 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  62.15 
 
 
262 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  62.55 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  61.35 
 
 
262 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  63.35 
 
 
262 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  63.35 
 
 
262 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  63.35 
 
 
262 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  62.95 
 
 
262 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  62.95 
 
 
262 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  62.95 
 
 
262 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  62.95 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  62.95 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  62.95 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  62.95 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  62.95 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  60.41 
 
 
262 aa  278  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  60.56 
 
 
262 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  55.39 
 
 
284 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  51.82 
 
 
286 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  53.96 
 
 
281 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  53.96 
 
 
279 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  57.2 
 
 
293 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  54.77 
 
 
288 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  52.92 
 
 
282 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  47.64 
 
 
278 aa  255  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  49.3 
 
 
287 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  51.3 
 
 
268 aa  244  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  52.45 
 
 
253 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  49.8 
 
 
244 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  53.31 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  46.32 
 
 
283 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  53.36 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  49.25 
 
 
256 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  46.56 
 
 
263 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  41.47 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  41.47 
 
 
258 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  39.47 
 
 
265 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  42.64 
 
 
256 aa  175  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  39.3 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  38.49 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  38.55 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  38.55 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  43.08 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  37.6 
 
 
260 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  38.37 
 
 
259 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  38.37 
 
 
259 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  38.37 
 
 
259 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 
259 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  36.72 
 
 
260 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  36.92 
 
 
260 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 
260 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  38.49 
 
 
259 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  39.3 
 
 
259 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  37.21 
 
 
260 aa  168  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  38.11 
 
 
290 aa  168  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  36.92 
 
 
260 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  39.33 
 
 
264 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  39.3 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  36.64 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  41.09 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  36.58 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  40.15 
 
 
258 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 
257 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  34.85 
 
 
256 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  38.08 
 
 
255 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  35.74 
 
 
254 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  35.14 
 
 
267 aa  158  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  33.46 
 
 
263 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  35.66 
 
 
254 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  35.77 
 
 
257 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  35.77 
 
 
257 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  36.54 
 
 
260 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  35.77 
 
 
257 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  35.77 
 
 
257 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  35.77 
 
 
257 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  36.36 
 
 
257 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  35.55 
 
 
254 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  35.41 
 
 
254 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  39.26 
 
 
278 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  38.53 
 
 
225 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  36.43 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  32.42 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  38.26 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  32.69 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  32.69 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 
254 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  31.92 
 
 
256 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  32.3 
 
 
278 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  36.56 
 
 
232 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  34.53 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  34.69 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  34.24 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  35.74 
 
 
259 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>