More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  100 
 
 		 225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  96 
 
 		 259 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  77.23 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  74.11 
 
 		 259 aa  338  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  71.88 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  68.75 
 
 		 258 aa  329  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  68.3 
 
 		 258 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  63.39 
 
 		 232 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  65.18 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  68.75 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  69.2 
 
 		 258 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  47.69 
 
 		 256 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  45.58 
 
 		 262 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  45.58 
 
 		 262 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  45.58 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  43.05 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  45.12 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  42.15 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  45.12 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  42.66 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  43.72 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  43.26 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  44.19 
 
 		 262 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  43.72 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  41.52 
 
 		 283 aa  174  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  43.26 
 
 		 262 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  43.26 
 
 		 262 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  43.26 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  43.26 
 
 		 262 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  43.26 
 
 		 262 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  43.26 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  43.26 
 
 		 262 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  46.19 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  41.89 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  40.18 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  43.05 
 
 		 268 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  45.09 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  43.18 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  41.26 
 
 		 257 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  42.4 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  42.33 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  42.25 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  41.23 
 
 		 270 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  40.35 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  40.93 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  42.13 
 
 		 259 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  42.13 
 
 		 259 aa  164  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  42.13 
 
 		 259 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  43.12 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  37.33 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  46.88 
 
 		 282 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  41.2 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  41.2 
 
 		 260 aa  161  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  41.67 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  40.09 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  42.99 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  42.53 
 
 		 279 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  42.79 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  40.74 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  42.99 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  42.99 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  42.79 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  42.99 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  42.99 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  39.71 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  40.74 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  40.99 
 
 		 259 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 278 aa  158  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  44.64 
 
 		 258 aa  157  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  34.38 
 
 		 258 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  38.76 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  36.49 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  41.7 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  40.37 
 
 		 275 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  39.64 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  44.54 
 
 		 293 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  36.04 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  42.11 
 
 		 283 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  41.78 
 
 		 288 aa  151  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  33.94 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  38.53 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  40.81 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  40.79 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.04 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  37.32 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  38.97 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  33.93 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  34.82 
 
 		 256 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  34.8 
 
 		 243 aa  148  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  34.38 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  42.73 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  34.38 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.38 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  39.91 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  34.51 
 
 		 256 aa  147  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.38 
 
 		 255 aa  147  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>