More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1683 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 272 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  39.69 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  36.58 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  36.68 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  36.55 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  37.31 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  37.31 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  36.96 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  36.96 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  37.4 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  41.25 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  38.37 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  37.02 
 
 		 259 aa  152  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  37.02 
 
 		 259 aa  152  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  36.36 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  37.02 
 
 		 259 aa  152  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  36.54 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  31.19 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  36.43 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  37.02 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  36.33 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  35.91 
 
 		 265 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  36.96 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  36.43 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  35.27 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  36.15 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  35.79 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  34.73 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  37.92 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  35.16 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  36.26 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  32.44 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  34.08 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  35.38 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  35.11 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  34.36 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  35.25 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  35.41 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  33.21 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  35.27 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  31.05 
 
 		 280 aa  138  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2017  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  33.59 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  35.02 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2387  hydrolase, TatD family  39.84 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  33.98 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  34.48 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  35.02 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  36.7 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  30.83 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  33.85 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  35.02 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  35.02 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  34.87 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  32.82 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  32.7 
 
 		 606 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  34.1 
 
 		 254 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  32.42 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  33.71 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  30.19 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  36.67 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  33.46 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  31.06 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  35.55 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  35.52 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  40.64 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  35.51 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  33.09 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  40.64 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  35.06 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  34.23 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  30.38 
 
 		 462 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  35.51 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  34.62 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  35.38 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  30.19 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  35.38 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  35.16 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  34.22 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  32.95 
 
 		 457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  35.51 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  35.51 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  35.51 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  32.18 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  35.91 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.8 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  32.82 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  31.68 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  32.17 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  30 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  32.05 
 
 		 464 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  29.12 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  32.58 
 
 		 258 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.12 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  29.12 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  29.12 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.12 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  29.12 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>