More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_805 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  100 
 
 		 264 aa  547  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  85.61 
 
 		 264 aa  474  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  85.23 
 
 		 264 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  44.71 
 
 		 464 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  46.9 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  44.02 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  43.75 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  43.36 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.36 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  43.75 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  43.36 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.97 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  42.69 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.58 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  44.31 
 
 		 606 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  41.63 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  42.02 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  38.98 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  38.98 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  44.75 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  42.02 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  43.68 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  41.18 
 
 		 462 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  41.31 
 
 		 462 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.15 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  40.38 
 
 		 458 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 458 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.61 
 
 		 457 aa  201  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  39.46 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  38.52 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  39.22 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.84 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  38.61 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  38.67 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  41 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  37.26 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  39.76 
 
 		 271 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  38.28 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  39.3 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  40.31 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.67 
 
 		 257 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  37.93 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  40.46 
 
 		 461 aa  188  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  39.37 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  39.37 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  39.16 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  37.35 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  37.35 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  39.08 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  37.01 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  36.72 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  35.32 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  36.58 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  38.08 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  40.15 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  40.15 
 
 		 454 aa  179  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  38.28 
 
 		 262 aa  178  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  36.61 
 
 		 263 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  39.23 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  36.96 
 
 		 259 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  37.31 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  36.72 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  38.37 
 
 		 255 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  36.54 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  38.22 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  37.31 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  37.21 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  39.06 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  37.01 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  37.21 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.82 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  39.53 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  35.64 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  37.35 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  37.35 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  38.85 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  35.91 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  35.91 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  34.88 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  35.91 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  36.33 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.8 
 
 		 459 aa  172  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  35.91 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  35.25 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  36.54 
 
 		 263 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  35.69 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  36.96 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  37.21 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  39.15 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  36.82 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  36.36 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  38.82 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1083  TatD-related deoxyribonuclease  36.88 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>